致病性与无致病性茄科罗尔斯通氏菌转录组测序与分析
2021-11-20周大祥龙泉洲李彦杰邓雪松
微生物学杂志 2021年5期
关键词:差异
周大祥,龙泉洲,李彦杰,邓雪松
(1.重庆三峡学院 生物与食品工程学院,重庆 万州 404120;2.重庆三峡医药高等专科学校 基础医学部,重庆 万州 404120)
茄科罗尔斯通氏菌(Ralstoniasolanacearum)是一种可在全球范围内造成严重危害的重要植物病原细菌,可侵染50多个科的数百种植物,其中对茄科植物的危害最严重,是世界上分布最广、危害最重且最难防治的重大细菌性病害[1]。茄科罗尔斯通氏菌作为一个复杂的群体,生理分化明显,不同寄主来源的菌株在寄主范围、演化型(Phylotype)、生化型和致病力等细菌学特征上有很大差异[2-5]。国内外学者对茄科罗尔斯通氏菌的研究主要从分泌系统[6]、群体感应[7]、毒性基因[8]和致病力分化[9]等方面进行。最近王晓林[10]报道对青枯菌菌株Po82在铜胁迫及侵染过程中的转录组分析,发掘了新的铜抗性相关基因,但利用转录组技术全面挖掘茄科罗尔斯通氏菌致病相关基因,对其通过哪些信号通路响应致病过程还未见报道。本研究首先从染病番茄中分离出致病性和无致病性茄科罗尔斯通氏菌,进行转录组测序,通过基因差异表达、COG、GO和KEGG等分析方法,挖掘茄科罗尔斯通氏菌在不同致病力条件下的转录本差异,以期加深对茄科罗尔斯通氏菌在不同致病力条件下基因表达的理解,为进一步深入研究茄科罗尔斯通氏菌致病分子机理提供参考。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 菌株 致病性茄科罗尔斯通氏菌(Ralstoniasolanacearum)(RS+)和无致病性茄科罗尔斯通氏菌(RS-)从番茄植株上分离,由西南大学植物保护学院马贯华鉴定并馈赠。……
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