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赣南地区汉族人群29个Y-STR基因座的遗传多样性及系统进化分析

2021-11-05张译文莫晓婷李生斌

激光生物学报 2021年5期

张 建,白 雪,张译文,张 成,王 郗,莫晓婷,叶 健*,李生斌

(1. 西安交通大学生物证据研究院,国家生物安全证据基地,西安 710049;2. 公安部物证鉴定中心,北京 100038;3. 中国科学院北京纳米能源与系统研究所,北京 100083;4. 北京大学信息科学技术学院,北京 100871)

Y染色体是决定生物个体性别的性染色体的一种,为男性特有,因此可采用Y染色体分析法对家史溯源、家系遗传和祖先鉴定开展研究[1-3]。本研究选取江西省南部的瑞金、兴国等地区(以下简称“赣南地区”)汉族人群为研究对象,获取该地区男性个体DYS460、DYS389I、DYS390、DYS533、DYS389II、DYS392、DYS518、DYS508、DYS458、DYS437、DYS385ab、GATA-H4、DYS576、DYS643、DYS456、DYS391、DYS447、DYS438、DYS448、DYF387S1、DYS393、DYS635、DYS439、DYS19、DYS444、DYS449、DYS481 29个Y-STR(Y chromosome short tandem repeats)基因座的遗传学数据,旨在对该人群的基因特征、人口迁徙、基因融合进化等进行分析,为该地区的群体遗传学和法医学研究应用提供基础数据参考。

1 材料与方法

1.1 样本来源

采集赣南地区1 532例汉族健康男性无关个体的静脉血样本于采集卡并干燥保存。本研究得到公安部物证鉴定中心科研伦理委员会的批准(审批编号:2020-009),所有样本供者在采样前签署了知情同意书。

1.2 试剂与仪器

DNATyperTMY29试剂盒(公安部物证鉴定中心,中国),Mastercycler pro型基因扩增仪(Eppendorf公司,德国),3730型遗传分析仪(ABI公司,美国)。

1.3 复合扩增及电泳检测

采用直接扩增法操作[4-6],按照DNATyperTMY29试剂盒说明书建议的反应体系和条件进行复合扩增 :72℃ 20 min ;95℃ 11 min,94℃ 30 s,59℃3 min,31个循环;60℃ 59 min。扩增产物用3730型遗传分析仪进行毛细管电泳检测分析,运用GeneMapper IDX1.4软件对数据结果进行Y-STR分型。

1.4 统计分析

用直接计数法计算各个基因座的等位基因频率和单倍型频率,其中两个双拷贝基因座DYS385ab、DYF387S1按照单倍型计算。……

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