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SPP1在非小细胞肺癌中的表达差异及机制研究

2021-10-29张丹丹徐健

临床肺科杂志 2021年11期
关键词:肺癌数据库分析

张丹丹 徐健

肺癌为一种呼吸系统常见恶性肿瘤,肺癌在全球癌症发病率和死亡率中排名第一[1]。肺癌可分为:小细胞肺癌(SCLC)和非小细胞肺癌(NSCLC),其中NSCLC占肺癌的80%~85%,主要病理类型为肺腺癌和肺鳞癌[2]。尽管在过去30年中肺癌治疗和生存方面取得了进展,但肺癌患者生存状况的改善相对较小,促使人们对肺癌治疗的新模式进行了研究。目前基因靶向治疗及免疫治疗取得了一定进展,但早期诊断和治疗对于肺癌非常重要。因此有必要探索新的治疗靶点,更能有效改善患者预后。

分泌磷蛋白1(SPP1)又称骨桥蛋白,研究发现,SPP1基因参与消化系统肿瘤发生及转移[3-4],其高表达与肿瘤的发生发展明显相关[5]。有关SPP1在NSCLC中的表达以及预后研究较少,我们拟通过一系列在线数据库,分析SPP1在NSCLC中的作用,探索其内在机制。

资料和方法

一、SPP1表达水平分析

首先通过Oncomine数据库分析SPP1在不同类别肿瘤中表达水平,P-value=1E-4,Fold change=2。其次,通过GEPIA和Ualcan数据库了解SPP1在NSCLC表达情况。

二、SPP1蛋白-蛋白网络分析

通过STRING数据库查找NSCLC中与SPP1表达关联的蛋白,采用蛋白-蛋白相互作用进行网络分析。

三、通过WebGestalt数据库对与SPP1相互作用的基因进行功能富集分析和KEGG信号通路分析。

四、生存分析

通过Kaplan-Meier plotter分析SPP1基因分别在高表达和低表达NSCLC患者中生存情况,以总生存期(Overall Survival,OS)、首次进展生存期(First Progression ,FP)为生存分析的指标。

五、免疫浸润分析

六、统计分析

差异表达、蛋白网络等采用在线软件分析。生存数据采用log-rank检验,P<0.05为有统计学差异。

结 果

一、SPP1基因表达

在Oncomine数据库中,SPP1在大多数肿瘤中存在高表达。……

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