等位功能连接（Homotopic functional connectivity）分析方法，是评价双侧半球之间对等/等位区域功能连接的方法，此方法可基于体素、节点或特定的兴趣区进行。其中，镜像体素等位功能连接（voxel-mirrored homotopic connectivity，VMHC）就是基于体素进行的全脑静息态等位功能连接分析方法，评价左右侧半球对应体素之间的相关性。虽然脑电图很早就用于显示静息状态下左右侧半球对等位置的同步电活动，但是随着静息态技术的发展，近几年静息态数据更常用于分析双侧半球对等位置活动的相关性。等位功能连接分析方法可用于评价双侧半球的功能整合情况，更好地反映人脑双侧半球间的功能组织。当然，等位功能连接分析方法也有着自身的局限性，一是双侧半球数据是对称的，二是由于双侧半球通过胼胝体存在较强的联系，这样内侧区域的脑组织具有更高的等位功能连接，而外侧部分脑组织的等位功能连接较低，这些在分析等位功能连接结果时都需要注意。