牛晓辰，高 艾，吉 泽，曹灵杰，苏龙龙，王昕苑

(山西医科大学，太原 030000)

星形细胞瘤(Astrocytoma)起源于星形胶质细胞，是颅内最常见的肿瘤，约占神经上皮组织肿瘤的70%以上。WHO分级为Ⅰ～Ⅱ级(低级别胶质瘤，LGG)与Ⅲ～Ⅳ级(胶质母细胞瘤，GBM)。该类肿瘤恶性程度高，预后较差，具有侵袭性生长的特点，手术难以全切且易复发，治疗非常困难，有效抑制星形细胞瘤的发生发展成为肿瘤生物治疗的难点之一[1-2]。微小RNA(microRNA，miRNA)是一类广泛存在于动植物体内的短链非编码RNA，仅有21～23个核苷酸序列，通过抑制翻译或促进细胞质中mRNA降解来控制转录后的基因表达[3]。研究表明，miRNA在肿瘤的生长发育、信号转导、细胞分化、增殖和能量代谢等进程中都发挥重要作用[4]。但有关miRNA与星形细胞瘤治疗的研究报道较少，本研究利用GEO数据库中有关星形细胞瘤的miRNA与mRNA两个表达数据集，通过生物信息学手段筛选与星形细胞瘤患者生存预后相关的miRNA-mRNA调控关系对，为该类肿瘤的基础研究与临床治疗提供重要靶点和参考。

1 材料与方法

1.1 检索策略与芯片数据

以“astrocytoma”或“glioma”与“miRNA”或“mRNA”为检索词在美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information，NCBI)的基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus，GEO)检索芯片数据，共检索到5个符合要求的miRNA数据集(分别是GSE103228、GSE90603、GSE25631、GSE65626和GSE138764)与15个mRNA数据集(分别是GSE1993、GSE4271、GSE4412、GSE7696、GSE8692、GSE16011、GSE19728、GSE21354、GSE24072、GSE45921、GSE103227、GSE90598、GSE25630、GSE65626和GSE138999)。综合考虑样本数量、信息完整度与可靠性，下载miRNA表达数据集GSE138764，包含有9例正常脑组织样本和33例星形细胞瘤样本的miRNA测序信息，检测平台为GPL18402 Agilent-046064 Unrestricted_Human_miRNA_V19.0_Microarray (miRNA ID version)。下载mRNA表达数据集GSE19728，包含有4例正常脑组织样本和17例星形细胞瘤样本的mRNA测序信息，检测平台为GPL570 [HG-U133_Plus_2] Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array。……