通过生物信息学分析鉴定CYB561与浸润性乳腺癌不良预后相关
2021-10-18丁庆林魏艳红胡康洪
丁庆林,魏艳红,孙 鸽,胡康洪
(湖北工业大学 生物工程与食品学院中德生物医学中心,湖北省工业微生物重点实验室,教育部及国家外专局“细胞调控与分子药物学科111创新引智基地”, 武汉 430068)
浸润性乳腺癌(Breast invasive carcinoma, BRCA)是全世界女性癌症死亡的第二大原因[1]。BRCA被认为是一种复杂的异质性疾病,基于组织病理学特征和治疗反应,其表现出显著的多样性,传统疗法(如乳房X线照相术)无法更好应对乳腺癌的挑战[2]。与肿瘤细胞增殖相关的基因标记在预测乳腺癌的预后方面具有局限性[3],需要不断完善乳腺癌的治疗策略,以达到更好的患者预后[1,4]。免疫细胞浸润在乳腺癌发展进程中与预后相关联,关注免疫细胞浸润可以帮助患者寻找新的治疗方法,借助公共数据库进行数据分析,有助于更好地寻找乳腺癌预后或预测生物标志物[3,5]。研究表明, BRCA1相关环指结构域-1 (BRCA1-associated RING domain, BARD1)在乳腺癌中上调,其高表达与乳腺癌的无病生存(Disease-free survival, DFS)和远处无转移生存(Distant metastasis-free survival, DMFS)差有关[6];血清脂质运载蛋白1(Lipocalin-1, LCN1)在BRCA中高表达,低表达LCN1与BRCA中无复发生存(Relapse-free survival, RFS)的不良预后相关[2];Janus激酶1 (Janus kinase-1, JAK1) 在乳腺癌中低表达,且与较差的总体生存(Overall survival, OS)和无复发生存(RFS)有关[7];脂滴包被蛋白(Perilipin-1, PLIN1)在乳腺癌中明显下调,与较差的总体生存(OS)相关[8],这些数据揭示了乳腺癌中具有预后意义的潜在基因治疗靶标。
细胞色素b561(Cytochromes b561, CYB561)又称Uniprot P49447,因在561 nm处具有吸光性而得名。CYB561氨基酸序列高度保守,是具有6个跨膜结构域的单体蛋白质[9]。该蛋白质附着在神经内分泌组织中的儿茶酚胺和神经肽分泌小泡的膜上,对儿茶酚胺的生物合成至关重要[10]。……
