基于铁死亡相关基因构建肝细胞癌的预后模型
2021-10-10王道笃赵其炯周志标何永越
岭南现代临床外科 2021年4期
王道笃,赵其炯,周志标,何永越
原发性肝癌是全球第七大最常见的恶性肿瘤,肝细胞癌是原发性肝癌主要类型(75%~85%),具有预后差、复发率高的特点[1]。肝细胞癌在患者之间、肿瘤间以及肿瘤内,都具有高度的异质性[2-4]。在全球范围内,肝细胞癌患者的总体生存率差异显著。由于复杂的病因以及高度的异质性,使得对于该疾病的预后研究具有高度的挑战性。由于目前肝细胞癌治疗手段有限,急需开发新的预后模型。
铁死亡是最近发现的一种铁依赖性的细胞程序性死亡的形式,不同于细胞坏死、细胞凋亡、细胞自噬,铁死亡是由脂质过氧化的积累驱动的[5,6]。近年来,诱导肿瘤细胞铁死亡已经成为了一种有前景的治疗方式,尤其是针对传统治疗方法无效的恶性肿瘤[7,8]。最近的研究表明,除铁死亡诱导基因外,许多其他的基因也被确定为铁死亡的调节因子或标志物。目前,这些铁死亡相关基因与肝细胞癌患者的预后的关系尚未明确。
本研究从癌症基因图谱(TCGA)数据库以及国际癌症基因组联盟(ICGC)数据库下载了肝细胞癌患者的基因表达谱及相应的临床病理数据。然后,我们在TCGA队列中构建了铁死亡相关基因预后模型,并在ICGC队列中验证了此模型。此外,我们进行了功能富集分析,以探讨其潜在机制。
1 材料与方法
1.1 数据收集
从TCGA(https://portal.gdc.cancer.gov/)数据库及ICGC(https://dcc.icgc.org)数据库中下载肝细胞癌患者的基因表达谱及相应的临床病理数据,最终在TCGA数据库中纳入了370名肝细胞癌患者作为训练队列,在ICGC数据库中纳入了231名肝细胞癌患者作为验证队列。……
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