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基于免疫组织化学、组织芯片和RNA测序数据分析MACC1在结直肠癌的临床病理学意义

2021-09-04吴共发邱丽浈刘海盛曾宇婷黄绮亭曾炼坤徐润强李海刚

关键词:数据库分析

吴共发,邱丽浈,刘海盛,曾宇婷,黄绮亭,曾炼坤,徐润强,李海刚,6*

(广州医科大学附属第四医院1病理科,2健康管理中心,3麻醉科,4内三科,5普外科,广州 511300;6中山大学孙逸仙纪念医院病理科,广州 510120)

结直肠癌(colorectal carcinoma,CRC)是全世界病死率居第3位的恶性肿瘤[1]。在我国,CRC发病率逐年提高,已居恶性肿瘤第3位[2]。迄今CRC的治疗以外科手术为主,结合放化疗及靶向治疗等方法,但其根治术的5年生存率仅约50%,侵袭和转移仍是死亡的主要原因[1]。因此,利用生物大数据发现并研究与CRC关系密切的新型分子标志物,对于提高疾病早期诊断、患者生存率及临床治疗效果具有重要的现实意义。结肠癌转移相关基因-1(metastasis-associated in colon cancer-1, MACC1)是2009年被证实的一个与CRC转移密切相关的基因[3],有望为CRC分子靶向治疗提供新靶点。目前国内外针对MACC1在CRC中的相关研究均有报道,但MACC1在CRC发生、发展以及作为治疗靶点的相关机制尚未完全阐明。Human Protein Atlas(HPA)数据库是一个巨大的基于RNA测序和免疫组化分析的转录组和蛋白质组数据库,在蛋白表达分析上具有重要价值[4]。Gene Expression Profiling Interactive Analysis (GEPIA)数据库是在肿瘤基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)与基因型-组织表达(the genotype-tissue expression,GTEx)这两大著名转录组数据库基础上建立的可视化癌症大数据分析平台[5]。本研究通过免疫组织化学检测CRC中的表达并结合挖掘HPA与GEPIA 两大数据库中相关信息,分析MACC1的蛋白和mRNA在CRC组织中的表达差异、与CRC发病密切相关分子的关系以及与临床病理特征分期和预后的关系,为进一步研究MACC1基因在CRC中的作用机制提供线索与思路。

材料与方法

1 临床资料

选取广州市增城区人民医院病理科库存的2015年3月至2017年12月手术切除的77例大肠癌及癌旁石蜡组织,均经过4%中性甲醛固定及石蜡包埋。……

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