上海市售牡蛎中诺如病毒的污染及基因型和流行趋势分析
2021-08-24贾添慧王永杰杨明树时沙沙喻勇新
贾添慧,王永杰,2,杨明树,时沙沙,董 蕾,喻勇新,2
(1.上海海洋大学 食品学院,上海 201306; 2.农业农村部 水产品质量安全贮藏保鲜风险评估实验室(上海),上海 201306)
诺如病毒(Norovirus, NoV)属于杯状病毒科(Caliciviridae),诺如病毒属(Norovirus)。目前,NoV分为10个基因群(GI-GX),其中,GI和GII型是最常见的人诺如病毒[1-2]。在2006—2016年间,中国发生超过132起NoV的暴发(8 133起案例),其中99.9%的案例都是由GI和GII型NoV引起,造成了医疗资源浪费和经济的损失[3-5]。
NoV相关的急性肠胃炎暴发通常与被NoV污染的牡蛎有关[6]。相关研究表明,几乎所有的GI型和大部分GII型NoV的基因型在牡蛎中检出[7]。食用受NoV污染的牡蛎具有感染NoV的风险,并可能导致NoV在人群中暴发[8]。Meghnath等[9]在研究两起NoV相关的急性肠胃炎疫情(共449例)中发现,疫情都与食用受NoV污染的牡蛎有关。
本研究采用巢式RT-PCR法对上海市售牡蛎进行人诺如病毒(GI和GII型)污染状况的定期监测,旨在分析上海市售牡蛎中NoV的基因型和流行病学趋势,以期对市售牡蛎的食用安全评估和食源性NoV的防治提供参考。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 主要试剂
动物组织总RNA提取试剂盒(货号:GK3016)购自上海捷瑞生物工程有限公司;RNA稳定和储存溶液RNAlater购自上海翊瑞生物科技有限公司;一步法反转录PCR试剂盒(货号:RR055A)、PremixTaq(RR901A)购自宝生物工程(大连)有限公司;Top10感受态细胞,5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷(X-gal),异丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷(Isopropyl β-D-Thiogalactoside, IPTG),氨苄青霉素和PCR产物回收试剂盒(DP209),100 bp DNA Ladder购自天根生化科技(北京)有限公司;LB固体和液体培养基购自北京陆桥技术股份有限公司;T载体PCR产物连接试剂盒(B522214),GI和GII型NoV的巢式RT-PCR通用型引物购自生工生物工程(上海)股份有限公司(序列见表1)。……
