储存红细胞中circRNA变化对泛素介导蛋白水解通路调控的预测分析*
2021-08-24张怡宇黄国清张勇刚苑召虎王强陈小洁黄建云李楠魏亚明
张怡宇 黄国清 张勇刚 苑召虎 王强 陈小洁 黄建云 李楠 魏亚明
国内红细胞一般在血库条件下可保存35天,在这个过程中,会发生储存损伤,继而储存损伤会影响红细胞的寿命及输注质量。红细胞内蛋白质发生降解也是储存损伤中的重要现象之一。泛素介导的蛋白水解通路是细胞质依赖于ATP的非溶酶体途径的蛋白质降解通路[1]。泛素是一种热稳定蛋白质,通过与蛋白质的共价酰胺键结合将其降解[2]。在网织红成熟过程中,细胞膜的蛋白组成发生变化,其中微管蛋白和肌动蛋白发生降解,而这种降解部分由泛素-介导的蛋白水解途径实现。不仅如此,它还能降解红细胞中的游离α-珠蛋白、变性异常的蛋白质,而且能降解细胞转录因子、细胞内膜蛋白和细胞周期蛋白等天然蛋白质[2-4]。泛素相关的酶主要包括:泛素激活酶E1,泛素载体蛋白E2和泛素蛋白连接酶E3,不同E3酶的底物特异性决定了哪些蛋白质能发生降解[5]。
环状RNA(circRNA,circular RNA)是一种比线性RNA更稳定的环形分子,是红细胞中转录组的天然组成部分[6]。有很多研究发现circRNA是miRNA海绵,通过多个结合位点吸附大量miRNA,从而解除miRNA对mRNA的抑制作用,促进mRNA表达[7,8]。circRNA在形成环化同时会影响其母基因生成线性RNA的丰度,从而达到调节母基因蛋白质翻译的目的。circRNA能与RBP(RNA binding proteins,RNA结合蛋白)特异性结合,发挥生物学功能。若circRNA发生聚集,由于其环形分子可产生三级结构,对与之结合的大量RBP不仅起到了分类隔区的支架作用,与mRNA比,也产生了其特有的与多组蛋白质结合的能力,能增加circRNA转录本的稳定性[9,10]。……
