APP下载

高、低产蛋量新疆伊犁鹅性腺轴转录组分析:基因结构分析与新基因发掘注释

2021-08-15吴盈萍古力娜巴克李海英赵晓钰姚莹莹梅志勇

中国畜牧杂志 2021年8期
关键词:分析

吴盈萍,古力娜·巴克,李海英,赵晓钰,马 晨,姚莹莹,曹 妍,梅志勇,潘 璐

(新疆农业大学动物科学学院,新疆乌鲁木齐 830000)

新疆伊犁鹅(Yili Goose)是新疆优良、珍稀的地方禽种,是我国唯一由灰雁(Anser anser)驯化而来的中小型家鹅品种[1]。新疆伊犁鹅的驯化历史较短、驯化程度较低,其具有一定的短距离飞行能力,耐粗饲、抗病力强、抗寒耐热且肉质优良,于2000 年8 月被农业部(现为“农业农村部”,下同)列入第一批国家级畜禽品种资源保护名录[2]。但新疆伊犁鹅的产蛋量较低,成年母鹅平均年产蛋量仅为8~12 枚[3],同时其就巢性很强,严重制约了地方鹅品种产蛋性能的提高。

转录组在研究畜禽生长发育及生理活动中发挥重要作用,也是表型关联研究的重要方法。随着转录组测序技术的快速发展,RNA-seq 技术已广泛应用于检测新的转录本[4]、差异基因筛选、可变剪接[5-7]、基因结构优化[8-9]以及SNP 筛查[10-11]等相关研究。张蕾[12]等人利用转录组测序技术对高邮鸭双黄蛋高、低产组卵巢组织进行测序,对测序数据进行质控和注释,筛选与高邮鸭双黄蛋产蛋性能相关的SNP 位点,在所覆盖的基因组数据中,检测到位于基因外显子区域的108 260~116 478 个SNP 位点,转换类型总数极显著高于颠换类型总数(P<0.01)。韩坤鹏[13]等通过转录组测序技术对京海黄鸡卵巢进行测序分析,基于所选参考基因组序列,共发掘4 431 个新基因,其中1 809 个新基因得到注释。本研究应用RNA-seq 技术对高、低产蛋量伊犁鹅性腺轴组织进行SNP 查找、可变剪切筛查、基因结构优化以及新转录本预测,为进一步解析产蛋量调控的分子机制提供理论依据。……

登录APP查看全文

猜你喜欢

分析
禽大肠杆菌病的分析、诊断和防治
隐蔽失效适航要求符合性验证分析
电力系统不平衡分析
电力系统及其自动化发展趋势分析
经济危机下的均衡与非均衡分析
对计划生育必要性以及其贯彻实施的分析
GB/T 7714-2015 与GB/T 7714-2005对比分析
网购中不良现象分析与应对
中西医结合治疗抑郁症100例分析
伪造有价证券罪立法比较分析