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利用生物信息方法寻找与绵羊脂代谢相关的候选基因

2021-08-15薛佳佳柳俭强于永生张立春马惠海金海国

中国畜牧杂志 2021年8期
关键词:实验

肖 成,薛佳佳,2,王 晶,3,柳俭强,于永生,张立春,马惠海,金海国*,曹 阳*

(1.吉林省农业科学院,吉林公主岭 136100 2.吉林农业大学动物科技学院,吉林长春 130000;3.延边大学农学院,吉林延吉 133000)

随着居民生活水平的提高,高品质羊肉越来越受到欢迎。遗传因素是影响肉质性状的重要因素之一,提高肌内脂肪含量能够显著提升肉质,而肌内脂肪含量受到脂肪细胞分化及脂滴积累的影响。因此,探究脂肪细胞分化形成的机制,寻找新的调控基因对于提高肌内脂肪含量有重要作用。

参与绵羊脂代谢的基因众多且复杂,不易找到相关的新调控基因,需借助生物信息学方法进行寻找。第2代测序技术可以高效准确地检测特定状态下细胞或组织全部的转录本信息,因此适合研究不同组织器官或发育阶段之间的差异表达基因[1]。目前,第2 代测序技术快速发展并已被广泛应用,大量测序数据被上传到公共平台。利用公共数据库进行数据挖掘,可以快速寻找到与脂代谢相关的预测基因。通过动物实验验证,可以快速锁定脂代谢相关候选基因,减少大量前期工作,缩短实验时间。本实验通过生物信息相关网站及分子实验结合方式,探究影响绵羊脂肪细胞分化的新标志基因,以期为深入探索绵羊脂代谢调控机理提供参考。

1 材料与方法

1.1 实验动物 实验选择2 月龄健康雄性绵羊(双乾肉羊)1 只,屠宰后取其腹股沟脂肪组织,用于分离绵羊前体脂肪细胞。选择体重相近(50 kg)的6 月龄健康雄性绵羊(杜寒杂交羊子一代)8 只,屠宰后取其肌肉、脂肪、十二指肠、小肠、心、肝、胃组织,置于冻存管中液氮保存,用于提取组织总RNA。……

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