杨文光，高汝青，闫瑾，何旺骁**

（1.西安交通大学第一附属医院人才高地，陕西 西安 710061；2.南昌大学医学院，江西 南昌 330031；3.西安交通大学第二附属医院国家地方联合生物诊断与治疗中心，陕西 西安710004）

蛋白质相互作用（protein-protein interaction，PPI）网络呈现基因产物彼此之间的物理相互作用，是理解细胞生命活动的基础，例如新陈代谢、细胞周期控制和信号转导等[1]。目前已经通过遗传学、生化或生物物理方法（例如荧光共振能量转移或X射线晶体学）鉴定许多蛋白质之间的相互作用。尽管PPI网络尚不完整且容易出错[2-3]，但是对该系统的研究已被证明对于破译网络中蛋白质结构和功能之间的关系、发现新的蛋白质功能、识别功能一致的模块和揭示保守的分子相互作用模式至关重要[4-6]。此外，PPI网络为联系不同的疾病与蛋白质[7]，研究药物-靶点的药理关系提供了强有力的工具[8-9]。

PPI是细胞进行生命活动的基础。反过来，这种相互作用的异常改变会扰乱细胞正常的生命活动，并导致包括癌症在内的许多疾病[10]。PPI界面的突变通常与蛋白质的功能丧失或获得有关[11]。例如，复制蛋白A是一种参与DNA修复、复制和重组的蛋白质。乳腺癌2号基因（breast cancer 2，BRCA2）发生癌症易感性突变使其削弱其与复制蛋白A的相互作用[12]。缺乏这种相互作用可能会抑制对DNA修复蛋白的招募，并最终导致致癌DNA的积累。此外，肿瘤抑制蛋白P53在细胞受到内/外刺激（例如DNA损伤、癌基因活化或氧化应激）时被激活，通过启动细胞周期阻滞、细胞衰老、DNA修复和细胞凋亡等途径抑制肿瘤细胞的产生[13]。……