张春雨 李小宇 刘峰 王永志

摘要 ：在吉林省7个主要甘薯种植区共采集85份甘薯叶片样品，利用小RNA深度测序技术对混合样品进行检测，经RT-PCR和测序验证，鉴定出样品中存在10种病毒，包括6种RNA病毒和4种DNA病毒。分别是马铃薯Y病毒科马铃薯Y病毒属的甘薯羽状斑驳病毒Sweet potato feathery mottle virus （SPFMV）、甘薯潜隐病毒Sweet potato latent virus （SPLV）、甘薯G病毒Sweet potato virus G （SPVG）、甘薯C病毒Sweet potato virus C （SPVC）、甘薯2号病毒Sweet potato virus 2 （SPV2）;长线形病毒科毛形病毒属的甘薯褪绿矮化病毒Sweet potato chlorotic stunt virus （SPCSV）;双生病毒科菜豆金色花叶病毒属的甘薯曲叶病毒Sweet potato leaf curl virus（SPLCV）;玉米线条病毒属的甘薯无症状1号病毒Sweet potato symptomless virus 1 （SPSMV1）;花椰菜花叶病毒科杆状DNA病毒属的甘薯杆状DNA病毒B Sweet potato badnavirus B （SPBV-B）和甘薯隐症病毒Sweet potato pakakuy virus （SPPV）。

关键词 ：甘薯病毒; 小RNA深度测序; 吉林

中图分类号：

S 435.311

文献标识码： A

DOI： 10.16688/j.zwbh.2020090

Identification of viruses in sweet potato samples collected from

Jilin province by small RNA sequencing

ZHANG Chunyu， LI Xiaoyu， LIU Feng， WANG Yongzhi*

（Jilin Academy of Agricultural Sciences， Gongzhuling 136100， China）

Abstract

85 samples of sweet potato leaf were collected from seven main sweet potato areas in Jilin province. Ten species of sweet potato virus were identified， including six RNA viruses and four DNA viruses， by using small RNA deep sequencing， RT-PCR and sequencing. The 10 viruses were Sweet potato feathery mottle virus （SPFMV）， Sweet potato latent virus （SPLV）， Sweet potato virus G （SPVG）， Sweet potato virus C （SPVC） and Sweet potato virus 2 （SPV2） in genus Potyvirus， family Potyviridae; Sweet potato chlorotic stunt virus （SPCSV） in genus Crinivirus， family Closteroviridae; Sweet potato leaf curl virus （SPLCV） in genus Begomovirus， family Geminiviridae; Sweet potato symptomless virus 1 （SPSMV1） in genus Mastrevirus， family Geminiviridae; Sweet potato badnavirus B （SPBV-B） and Sweet potato pakakuy virus （SPPV） in genus Badnavirus， family Caulimoviridae.

Key words

sweet potato viruses; small RNA deep sequencing; Jilin

甘薯Ipomoea batatas （L.） Lam.，旋花科甘薯屬，是我国重要的粮食作物和经济作物。甘薯在吉林省广泛种植，主产区在中部和西部，由于种植区特殊的地理气候特点，甘薯生长期昼夜温差大，品质高，口味佳，深受老百姓喜爱，是重要的经济作物，种植面积逐年增加。甘薯为无性繁殖作物，病毒病危害严重，造成产量质量受损，种质退化等。目前，全世界已鉴定出能够侵染甘薯的病毒共32种，分属于9个科[12]。在我国已发现侵染甘薯的病毒至少达15种[24]，报道最多的是甘薯羽状斑驳病毒Sweet potato feathery mottle virus （SPFMV）、甘薯褪绿矮化病毒Sweet potato chlorotic stunt virus （SPCSV）和双生病毒科的甘薯曲叶病毒Sweet potato leaf curl virus（SPLCV）等。近年来调查发现吉林省甘薯病毒病害日趋严重，但相关报道几乎没有。本研究对吉林省主要甘薯种植区进行采样调查，利用小RNA深度测序和RT-PCR对样品进行鉴定，对病毒种类进行初步了解，为今后甘薯病毒病的防控和脱毒育种提供依据。……