苟 萌，胡 婕，张彤彤，剧 柠

(宁夏大学 农学院,宁夏 银川750021)

原料乳指的是未经加工处理的生鲜牛乳,在富含多种天然营养物质的同时,也为微生物生长提供了绝佳的环境[1]。原料乳中微生物种类繁多,导致乳及乳制品在存储及加工过程中的变化具有复杂性。细菌是导致原料乳品质变化的主要微生物[2]。因此,研究原料乳中的细菌种类及数量对乳及乳制品的品质控制尤为重要。早期的微生物纯培养法、传统核酸扩增等技术操作复杂、检测灵敏度低,已经无法满足对乳及乳制品中微生物的深入研究。高通量测序技术也叫第二代测序技术,具有时效高、精度高、通量高、成本低、操作简单等优点,目前已被广泛应用于肠道环境、土壤、食品等领域的微生物多样性研究。

近年来各类测序平台快速发展,研究表明,不同测序平台因测序质量与深度的不同,对相同样本亦可产生不同的微生物多样性结果[3-4]。Illumina MiSeq测序与IonS5 XL测序是目前常用的高通量测序平台。Illumina MiSeq测序能够使多个样品在不同区域内同步测序,其读长较短,结果准确性高,覆盖度深,已被广泛用于研究醋[5]、豆酱[6]和茶叶[7]等食品,也是目前研究原料乳[8-9]、巴氏杀菌乳[10]、发酵乳[11]以及干酪[12]中微生物群落结构的重要工具。IonS5 XL测序平台的读长长于Illumina MiSeq平台,最长可达600 bp。测序时间比Illumina MiSeq更短,且成本更低,多被应用于肠道菌群、发酵肉[13]、冰鲜鸡肉[14]的微生物菌相分析,在乳及乳制品微生物研究中的应用报道较少。基于IonS5 XL测序时效性高、成本低的优点,利用它对原料乳中微生物进行测序,探究其是否适用于乳及乳制品微生物多样性的研究,能够为获取更加准确全面的乳及乳制品微生物信息提供方法依据。……