渠茂林

作者单位：呼和浩特市蒙医中医医院检验科，内蒙古自治区 呼和浩特 010010

非小细胞肺癌（NSCLC）是最常见的一种肺癌，包括鳞状细胞癌（鳞癌）、腺癌、大细胞癌，约占所有肺癌的 80%～85%，恶性程度高 ，易发生转移和扩散。目前，NSCLC 病人主要采用手术联合放化疗，以期延长病人的生存时间，但术后易复发转移，5年生存率很低。目前，NSCLC 发生发展的机制尚不清楚，从基因水平研究 NSCLC 的病理机制对提高早期诊断率、寻找治疗靶点、改善预后至关重要。配对盒基因 8（PAX8）是一种细胞系限制性转录因子，可以与靶 DNA 结合，调控相关基因的转移。已有研究显示，PAX8 在乳腺癌、胃癌、肾癌以及肺癌等多种恶性肿瘤中均存在异常高表达，但 其 在NSCLC 中的表达研究报道较少。高通量基因表达数 据 库（Gene expression Omnibus，GEO 数据库）是目前最大的面向公众提供数据查询和可进行提交数据进行储存交换的芯片公共数据库之一。因此本研究于 2019年 6月至 2019年 8月利用 GEO 数据库分析 PAX8 在 NSCLC 病人中的表达及其与病人预后的关系。

1 资料与方法

1.1 数据资料采集

利用在线工具 Oncomine（https：∕∕oncomine.org∕）选择 TCGA Lung 2 数据集，其中包括 1 537 个样本的基因表达谱数据，正常肺组织 390例，肺癌组织共 721例，血液样本 420例，无意义样本 6例，分析 PAX8 在肺癌组织与正常肺组织中的 表达情况 。 再 从 GEO 公共数据 库（https：∕∕www.ncbi.nlm.nih.gov∕gds）检索 NSCLC 的差异基因表达谱及相关临床数据，检索平台 Platforms：GPL570，数据集：GSE77803。

1.2 数据筛选及分组

下载 GSE77803（GPL570）基因表达 矩阵，156例NSCLC 病人 的数据 集包含 156例NSCLC 病人的基因表达谱数据和性别、年龄、病理类型、T 分期、N 分期和术后复发情况。……