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膜性肾病关键基因的生物信息学分析

2021-06-13窦涪琳刘庆珍徐巧莹刘海英傅余芹

山东医药 2021年16期
关键词:分析研究

窦涪琳,刘庆珍,徐巧莹,刘海英,傅余芹

山东大学第二医院,济南 250021

膜性肾病(MN)是成人肾病综合征最常见的病理类型,其病理特征为弥漫性肾小球基底膜增厚伴上皮下免疫复合物沉积。MN是由自身免疫反应引起的肾小球损害。自身抗体与足细胞靶向结合引起了免疫复合物沉积、肾小球基底膜增厚以及足细胞形态改变,从而导致蛋白尿的进展[1]。近年来在MN中发现了多种自身抗原,包括分泌型磷脂酶A2受体(PLA2R1)[2]、含7A的血栓反应蛋白1型结构域(THSD7A)[3]和神经表皮生长因子样1蛋白(NELL-1)[4],分别占MN患者的70%~80%、3%~5%及5%~10%。外周循环抗体的测定已成为临床重要的参考指标。体内外实验证据表明多种通路和细胞因子在MN的发病机制中起关键作用。然而,MN的分子机制尚不完全清楚。生物信息学分析允许在基因组水平上进行基因改变的筛选。然而,独立的微阵列分析常导致假阳性率。本研究从基因表达公共数据库(GEO)中获得MN患者的两个微阵列数据集(GSE108109、GSE115857),将原始数据进行一系列处理后,识别MN相关的Hub基因,应用NephonSeq v5平台分析Hub基因与MN临床特征的相关性,以便进一步探讨MN的发病机制以及涉及的关键基因。

1 材料与方法

1.1 微阵列数据搜索和下载 本研究中的微阵列数据从基因表达数据库(GEO)下载(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo)。搜索的关键词为“膜性肾病”,且符合以下标准:研究类型为表达谱基因芯片;组织来源为人类肾组织。基于上述标准,选择了GSE108109、GSE115857这两个数据集。GSE108109基于GPL19983,包括MN组44例,正常对照组6例;GSE115857基于GPL14951,包括MN组11例,正常对照组7例。

1.2 差异……

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