基于GEO数据库筛选动脉粥样硬化发生的关键差异circRNA
2021-06-08席建军程文俊鸿嘎鲁
内蒙古医科大学学报 2021年2期
李 晶,张 芸*,席建军,程文俊,鸿嘎鲁
(内蒙古医科大学附属医院全科医学科,内蒙古 呼和浩特 010050)
1 前言
心血管疾病(cardiovascular disease,CVDs)是导致全球发病和死亡的重要原因,每年影响数百万人。动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)是一种涉及不同细胞类型、多种细胞因子和粘附分子的慢性炎症,不稳定的动脉粥样硬化斑块破裂、血管狭窄或血小板聚集和血栓形成引起的闭塞可导致急性心血管疾病[1,2]。氧化低密度脂蛋白(OxLDL)具有高度的致AS作用,动脉粥样硬化的发病机制与巨噬细胞摄取低密度脂蛋白后转化为泡沫细胞密切相关[3]。因此,寻找与AS发展相关的生物标志物可以为临床研究提供理论依据。
环状RNAs(circRNAs)是一类广泛存在于各种生物细胞中具有调控基因表达功能的长链内源性非编码RNA,具有结构稳定和组织特异表达等特征[4],它们通常参与包括肿瘤在内的各种疾病的发生和发展。大量的研究数据表明,circRNAs在多种肿瘤组织和癌旁正常组织中的表达存在显著性的差异[5~9]。一些特异性表达的circRNAs可能成为肿瘤等多种疾病诊断和预后的新的生物标志物。Chen L等人发现circRNA_100290可能作为一种竞争性的内源性RNA(ceRNA),通过吸收miR-29b家族成员来调控CDK6在口腔鳞状细胞癌中的表达[10]。尽管circRNAs在各种疾病中发挥作用,但是与AS相关的circRNAs的表达和功能鲜有研究,进一步研究有望用于预防或治疗AS。
在过去的几十年中,微阵列技术和生物信息学分析被广泛应用于差异基因基因筛选。在我们的研究中,利用基因表达综合数据库……
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