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LRP8在胃癌中的表达及其在胃癌发生过程中的作用

2021-06-04郑鹏远任飞飞李发展

中国癌症杂志 2021年4期
关键词:胃癌数据库分析

刘 斌,郑鹏远,米 阳,任飞飞,高 爽,刘 传,李发展

1.郑州大学第五附属医院消化内科,河南 郑州 450052;2.郑州大学医学科学院,河南 郑州 450052

胃癌在所有肿瘤中发病率位居第五,死亡率位居第三[1]。胃癌每年超过一半发生在中国,是中国男性死亡率位居前列的癌症[2]。目前对胃癌的病因已有较为明确的结论,但是其发病机制仍未完全明确[3]。从分子层面来说,胃癌的发生涉及多个癌基因和抑癌基因、信号转导通路和细胞周期调控分子的变异等复杂过程[4]。本研究探讨低密度脂蛋白受体相关蛋白8(low-density lipoprotein receptor-related protein 8,LRP8)在胃癌组织与正常胃黏膜中是否存在差异表达,LRP8对胃癌细胞生物学行为的影响,并探寻其可能的机制及其与胃癌患者临床病理学特征及预后的关系。

1 资料和方法

1.1 临床资料

1.1.1 数据库资料收集分析

在人类癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库下载384例胃癌和3 7 例正常人的基因表达数据,在cbioportal(https://www.cbioportal.org)数据库中下载T C G A 数据库中具有完整临床病理学信息的240例胃癌患者数据,在基因表达汇编(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库中下载GSE13911[5]、GSE13861[6]的基因表达数据集,分析胃癌组织和正常胃黏膜中LRP8的表达差异。利用R(pheatmap)与R(corrplot)软件包分析与LRP8的共表达的基因,进一步通过DAVID分析工具对共表达基因进行基因本体(Gene Ontology,GO)分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析;在Kaplan-Meier plotter(www.kmplot.com)数据库中分析LRP8表达与胃癌患者预后的相关性。

1.1.2 标本来源

郑州大学第五附属医院2018年8月—2019年7月行全胃切除术或部分切除术的患者25例,其中男性17例,女性8例,年龄(63.6±11.4)岁,所有患者术前均未接受化疗和放疗。……

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