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中国荷斯坦奶牛TLR1和CBLB基因SNP位点筛选及分析

2021-05-19刘娟韩硕邹紫雯李鑫丽罗林沈冰蕾

中国生物制品学杂志 2021年5期
关键词:结构

刘娟,韩硕,邹紫雯,李鑫丽,罗林,沈冰蕾

黑龙江八一农垦大学动物科技学院,黑龙江大庆163319

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)主要是指由于单个碱基的改变引起基因组水平上的DNA序列多态性。SNP主要有2种表现形式:一种称为转换,即一个嘌呤被另一个嘌呤所代替,或一个嘧啶被另一个嘧啶所代替;一种称为颠换,即一个嘌呤被一个嘧啶所代替,或一个嘧啶被一个嘌呤所代替。转换和颠换比例约为2∶1,且多发生在T碱基与C碱基之间[1]。现阶段检测SNP的方法为将DNA混合后进行基因PCR扩增全长测序,与原序列进行比对找出SNP位点。

Toll样受体(Toll-like receptor,TLR)作为动物机体重要的模式识别受体,广泛存在于各类免疫细胞表面[2]。Toll样受体1(Toll-like receptor 1,TLR1)作为TLR家族的主要成员之一,对于引发和调节病原微生物的病原体的免疫反应具有重要作用。目前已发现TLR1基因可定位在6号染色体上,具有丰富的遗传多态性。研究表明,TLR1基因与中国荷斯坦奶牛的许多炎症相关疾病相关[3],具有显著影响泌乳性状和临床乳房炎的数量性状位点。OPSAL等[4]发现,挪威红牛TLR1基因第272位的C>T突变对乳房炎发生无影响。李春苗等[5]发现,中国荷斯坦奶牛TLR1基因mRNA区有4个SNP位点,且第1 596位的G>A突变位点产生的不同基因型对体细胞数影响极显著。

泛素化修饰是蛋白质转录后的重要调节形式,泛素化的过程与一系列的催化酶有关。包括泛素激活酶(E1)、泛素结合酶(E2)、泛素连接酶(E3)[6]。其中E3泛素连接酶是整个泛素化过程中最重要的部分,并且决定了泛素化的特异性。Cb……

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