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铁死亡相关基因在转移性骨肉瘤中的作用机制

2021-05-18周浩远徐海栋

医学研究生学报 2021年5期
关键词:分析

童 也,周浩远,赵 鹏,徐海栋

0 引 言

骨肉瘤是临床上最常见的恶性骨肿瘤,多见于儿童和青少年[1]。虽然手术联合新辅助化疗显著提高了局部肿瘤患者的5年生存率,但大部分的骨肉瘤患者都会发生转移,转移性骨肉瘤患者的5年生存率只有20%~30%[2-3]。目前,骨肉瘤仍是青少年发生癌症相关死亡的第二大因素[4-5]。

铁死亡是一种调节细胞死亡的新形式,以产生并积累铁依赖性脂质活性氧为特点的细胞氧化性死亡[6]。据报道,铁死亡与脂质代谢之间的相互作用在肿瘤发生发展,侵袭、转移、耐药性和肿瘤免疫中发挥重要作用[7]。此外,在多种类型的具有耐药性的癌细胞中,尤其是具有间充质和去分化特征的癌细胞更容易受铁死亡的影响[8-9]。最近的研究发现,HMOX1的过表达能够增加骨肉瘤细胞对EF24的敏感性,而EF24作为铁死亡的启动子,可以通过增加细胞脂质过氧化水平、细胞内铁浓度和活性氧来触发骨肉瘤细胞的铁死亡[10]。因此,铁死亡相关基因有希望成为骨肉瘤治疗新的潜在靶点。而本研究从GEO数据库中获取了转移性骨肉瘤组织样本数据,探讨铁死亡相关基因在转移性骨肉瘤中的潜在作用机制。

1 材料与方法

1.1数据获取与处理从GEO数据库(Gene Expression Omnibus,https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)中下载3个芯片数据集GSE21257(34个转移骨肉瘤样本,19个非转移骨肉瘤样本)、GSE14827(9个转移骨肉瘤样本,18个非转移骨肉瘤样本)和GSE32981(18个转移骨肉瘤样本,5个非转移骨肉瘤样本),其对应的平台文件分别为GPL10295、GPL96和GPL3307。在R软件中, GSE21257的芯片表达矩阵文件基于log2进行对数转换,GSE14827与GSE32981的原始芯片数据通过affy包做背景校正和标准化处理。……

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