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鸡繁殖性能近交衰退相关CpG岛差异甲基化基因的筛选

2021-04-27李国辉殷建玫张会永周成浩朱云芬邢伟杰苏一军邹剑敏

畜牧兽医学报 2021年4期
关键词:区域差异

薛 倩,李国辉,殷建玫,张会永,周成浩,朱云芬,邢伟杰,苏一军,邹剑敏,韩 威*

(1.江苏省家禽科学研究所,扬州 225125; 2.江苏省家禽科学研究所 科技创新中心,扬州 225125)

由于近交而引起的后代群体适合度下降的现象被称为近交衰退[1],近交衰退是物种资源保护尤其是濒危物种保护过程中备受关注的问题之一。群体遗传学提出了两个解释近交衰退遗传基础的经典假说: 显性假说和超显性假说。显性假说认为,近交过程中,基因组纯合性的增加导致了有害隐性等位基因的暴露;超显性假说提出,在整个基因组中,杂合子一般优于纯合子,近交增加了纯合子出现的概率,因此会表现出衰退[2]。近些年研究发现,这两种假说对于某些近交衰退现象却无法完全解释[2-6],比如近交衰退程度会随着环境压力的变化而变化的不确定现象等[7-8]。DNA表观修饰也会受到环境的影响,进而影响到基因的表达和表型的可塑性[9-11]。并且已有研究表明,近交衰退与DNA表观遗传修饰密切相关[12-14]。表观遗传变化是发生在基因组DNA中的重要变异,它在不直接改变DNA编码序列的情况下影响着基因的表达[15-16]。

DNA甲基化是目前研究最广泛的表观遗传修饰方式之一[17],其参与多种生物学过程[18-19],在调控基因表达和维持基因组稳定性方面起着关键的作用[20]。脊椎动物基因组DNA甲基化主要发生在 CpG胞嘧啶上,并且它的调控多为通过 CpG 岛(CpG island)多个 CpG 位点的甲基化共同作用来完成,而不是通过对某单个 CpG 位点的甲基化或去甲基化来激活或失活基因[21]。……

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