叶晓鲜，李明洋，朱珊丽，崔怀瑞，王昱，张丽芳

温州医科大学仁济学院基础医学部解剖教研室

分子病毒与免疫研究所，浙江温州325035

2019 年12 月，部分地区陆续出现感染新型冠状病毒（SARS-CoV-2）的肺炎患者，2003 年 2 月，我国广东暴发 SARS，2012 年 9 月，沙特暴发 MERS，这 3 次疫情均由冠状病毒（coronavirus，CoV）引发，患者均表现出严重的急性呼吸系统综合征。SARS-CoV-2 迅速在全世界范围内传播，截至目前，国内确诊病例超过10 万例，国外确诊病例超过1.3 亿例，疫情十分严峻，严重危害了人类健康，目前尚无特效药物进行防治［1］。

冠状病毒为具有衣壳（螺旋形状）和外套膜的线性单股正链 RNA 病毒，其基因大小为29 800 bp［2-3］，是已知RNA 病毒中最长的。冠状病毒间存在4 种较为保守的结构蛋白，由基因组的3′端编码，分别为S 蛋白（表面刺突蛋白）、E 蛋白（小包膜蛋白）、M蛋白（外膜蛋白）、N 蛋白（核衣壳蛋白［2，4］），主要参与病毒复制与感染过程。M 蛋白为一种跨膜糖蛋白，长222 个aa，在双层脂包膜的外表面有N-亲水性末端突出，可使宿主产生中和性抗体，其后面有3 个疏水的跨膜区，在第3 个跨膜区后面存在一段高度保守的氨基酸序列SmWSFNPE（SARS-CoV 中的也为SmWSFNPE）。C-末端亲水区位于病毒粒子内部，在病毒粒子出芽时进入病毒粒子核心，促进膜的弯曲变形，作用于病毒核壳体［5］。

本研究以SARS-CoV-2 M 蛋白的氨基酸序列为基础，应用计算机网络生物信息学软件，对其结构及B 细胞表位进行预测，为该蛋白的功能研究及疫苗研发奠定理论基础。

1 材料与方法

1.1 SARS-CoV-2 M 蛋白氨基酸序列获得及理化性质预测 通过NCBI GenBank 数据库检索获得SARS-CoV-2 M 蛋白的氨基酸序列，应用ExPASy 在线软件中的ProtParam 预测其理化性质。……