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基于网络药理学探讨白芍治疗贫血的机制

2021-03-25叶先文邓亚羚任洪民夏澜婷陈宇帆张金莲余亦婷

中成药 2021年3期
关键词:数据库生物信号

叶先文 ,邓亚羚,任洪民,夏澜婷,杨 明,陈宇帆,张金莲*,余亦婷

(1.江西中医药大学药学院,江西 南昌 330004;2.江西中医药大学现代中药制剂教育部重点实验室,江西 南昌 330004;3.赣州市人民医院,江西 赣州 341000)

白芍为毛茛科植物芍药Paeonia lactifloraPall.的干燥根,具有养血调经、柔肝止痛、平抑肝阳等功效,临床常用于治疗月经不调、胁痛、腹痛等症[1],为补血常用药。白芍主要化学成分有芍药苷、芍药内酯苷、没食子酸等[2]。

网络药理学是一门新兴的药理学探究技术,其分子对接及探究药物与靶点之间关系的方法符合传统中医治疗及辨证论治的理念[3]。本文利用各种在线数据库资源,通过网络药理学的研究方法(图1),结合TCMSP 等数据库预测药效成分靶点,使用Cytoscape 3.6.1 软件建立关于白芍治疗贫血的药物-成分-靶点-通路-疾病网络。

1 材料与方法

1.1 白芍化学成分数据来源 TCMSP (http://lsp.nwu.edu.cn/index.php) 是一个独特的中草药系统药理学台,能够搜索药物、靶点和疾病之间的关系,该数据库提供口服生物利用度(OB)、类药性(DL)、血脑屏障(BBB)等天然化合物的药代动力学特性[4]。本文以“白芍” 为关键词进行搜索,对搜索成分的结构以Mol2 格式进行保存,通过Chemspider(http://www.chemspider.com/)及Scifinder(https://www.cas.org/prod ucts/scifinder) 对其结构进行验证。

1.2 贫血相关靶点获取 GeneCards 是一个可搜索的、免费的、综合的数据库,给用户提供注释和预测人类基因的全面信息,它自动集成了来自约150 个web 源的以基因为中心的数据,包括基因组、转录组、蛋白质组、遗传学、临床和功能信息[5]。DisGeNET、Pubmed 同样可对疾病基因进行搜索,以 “Anemia” 为关键词,数据库类型为“Gene”,物种限定为“Homo sapiens”,对“贫血” 相关基因进行搜索。……

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