王希江 谭云洪 贺文从 欧喜超 刘东鑫 赵雁林

耐药结核病的广泛流行是结核病有效防控的巨大挑战。WHO[1]报告显示，2019年全球约50万例利福平耐药(rifampicin resistance tuberculosis, RR-TB)新发结核病患者，其中78%为耐多药结核病(multidrug-resistance tuberculosis，MDR-TB)患者。据估计，在这部分患者中，仅51%的患者被检测发现，30%的患者获得治疗，治疗成功率为56%[1]，这在很大程度上导致了RR/MDR-TB的传播和流行。目前，结核病的防控主要依赖于快速诊断和有效治疗，尤其是对耐药性的及时正确诊断是确定有效治疗方案、提高治愈率，进而阻断传播的基础。表型药物敏感性试验(简称“药敏试验”)价格昂贵、耗时较长，且对设备要求较高。目前包括GeneXpert®(Cepheid, USA)、GenoType MTBDR plus V2 (Hain Life science GmbH, Nehren, DE)及AID TB Resistance Line Probe Assay (AID GmbH, Strassberg, DE)等的一系列分子生物学检测方法，虽然可以实现快速检测，但仅针对某些特定的耐药基因，无法识别全部的耐药突变位点。全基因组测序(whole genome sequencing, WGS)基于整个4.4 Mb 结核分枝杆菌基因组进行检测，在提供全面的耐药突变位点同时，还可识别异质性耐药，很大程度上弥补了靶向分子方法的缺陷。

利福平(RFP)和异烟肼(INH)作为治疗结核病的基石，其耐药突变位点多样性已有报道[2-3]，进一步研究表明不同的突变位点及突变方向可能导致结核分枝杆菌的最小抑菌浓度(minimum inhibitory concentration, MIC)不同，而不同的MIC值可能会引起治疗效果的差异。因此，本研究以新疆维吾尔自治区(简称“新疆”)和湖南省国家耐药监测点的菌株为例，采用WGS全面了解RFP及INH耐药菌株分子特征的同时，将反映耐药水平高低的MIC值与耐药突变位点相结合，探究耐药突变基因型与耐药水平的量化关系，以期为我国相关分子生物学诊断方法的研发和临床用药方案及剂量的确定提供依据。……