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基于生物信息数据库分析FEN1基因在乳腺癌中的表达及其临床意义

2021-02-28李镠祎曹奔奔张婷王晨杨红健戴五敏蔡昀方

浙江医学 2021年3期
关键词:乳腺癌数据库

李镠祎 曹奔奔 张婷 王晨 杨红健 戴五敏 蔡昀方

乳腺癌是全球范围内女性最常见的恶性肿瘤,其死亡率居于女性恶性肿瘤的第二位[1]。近年来,随着生活方式、饮食习惯等多因素的改变,全球乳腺癌的发生率和死亡率都呈现上升趋势,在过去的40 年中,东亚女性的发病率更是迅速增加[2-3]。恶性肿瘤的发生、发展常涉及基因突变、基因表达异常、染色体畸变等遗传学改变。瓣状核酸内切酶1(flap endonuclease 1,FEN1)基因是BRCA2 合成致死(BRCA2 synthetic lethality,B2SL)基因的一种,编码一种结构特异性内切酶,参与冈崎片段成熟、DNA 重组、细胞凋亡DNA 片段化和长片段碱基切除修复等过程,在维持基因组稳定性和完整性方面发挥着重要作用[4-5]。FEN1 基因的功能缺陷(以体细胞突变和多态性形式出现)近来已被证明可导致自身免疫疾病、慢性炎症以及促进癌症的发生、发展。研究证明,FEN1 表达水平在前列腺癌、卵巢癌、肺癌等多种恶性肿瘤中增高,其中乳腺癌和子宫癌的表达水平增高更为明显,此外,FEN1 对于癌细胞的快速增殖至关重要,FEN1 基因的变异可降低女性患乳腺癌的风险,将FEN1 基因作为一个靶向治疗的靶点可以阻止乳腺癌进展[6-8]。本研究主要通过检索Oncomine、基因表达谱动态分析(gene expression profiling interactive analysis,GEPIA)、人类蛋白质图谱(human protein atlas,HPA)、肿瘤单细胞(CancerSEA)数据库和Kaplan-Meier Plotter 在线工具分析FEN1 基因在乳腺癌中的表达及其与临床病理分期、细胞功能状态、预后的相关性,为进一步探讨FEN1 基因在乳腺癌的发生、发展过程中的作用机制提供依据。

1 材料和方法

1.1 从Oncomine 数据库提取数据 Oncomine 数据库(https://www.oncomine.org/)是目前世界上最大的肿瘤基因芯片数据库及数据整合提取的平台,其中一项重要功能就是进行肿瘤组织和正常组织的基因差异表达分析[9-10]。……

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