牦牛源牛凸隆病毒的检测及其基因组特征
2021-02-27赵龙,汤承,2,岳华,2*
赵 龙,汤 承,2,岳 华,2*
(1.西南民族大学畜牧兽医学院,成都 610041;2.青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室,成都 610041)
牛凸隆病毒(bovine torovirus, BToV)是套式病毒目(Nidovirales)托巴套氏病毒科(Tobaniviridae)凸隆病毒亚科(Torovirinae)凸隆病毒属(Torovirus)的成员,凸隆病毒属的成员还包括马凸隆病毒(equine torovirus, EToV)和猪凸隆病毒(porcine torovirus, PToV)(国际病毒分类委员会:https://talk.ictvonline.org/)。BToV主要引起犊牛腹泻甚至死亡,同时,也可引起成年牛腹泻[1-2]。近年来,有学者从牛呼吸道样本中检测到BToV,证明其具有双重组织嗜性,推测也是潜在的呼吸道致病因子[3-4]。自1982年在美国首次报道以来,目前,世界上已有17个国家报道BToV的存在或流行,其已经具有广泛的地域分布[3-10]。
BToV为有囊膜单股正链RNA病毒,目前,GenBank中仅有5条BToV基因组序列,除加拿大BToV基因组为原型毒株Breda 1以外,其余均为基因Ⅱ型毒株。这5条BToV基因组长度为28 297~28 475 bp,基因组由5′UTR和ORF1a、ORF1b、S、M、HE、N6个ORF区以及3′UTR组成[11]。ORF1a、ORF1b为两个大的重叠ORF区,分别编码聚合酶pp1a和pp1b,在病毒的复制过程中起着重要作用[11]。S基因编码纤突蛋白(S蛋白),是诱导机体产生中和抗体的重要抗原[12],并且与病毒的致病性、组织嗜性和宿主范围密切相关[13-14]。S蛋白可在“类胰蛋白酶”裂解位点(1 003—1 007 aa)裂解为S1和S2两个亚基[15-16],S1亚基负责与宿主细胞表面的受体结合,S2亚基则介导病毒与宿主细胞的膜融合,在病毒的感染过程中起着重要作用[17]。M基因编码的膜蛋白在病毒的组装、成熟和核衣壳识别过程中起作用[18]。HE基因编码血凝素酯酶蛋白(HE蛋白),具有凝集素结构域(R)、酯酶结构域(E)和膜近端结构域(MP)3个结构域[19]。病毒通过HE蛋白实现与唾液酸的可逆性黏附,从而避免由于结合“假”受体而失去感染力,在启动感染的初期发挥重要作用[19]。……
