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牛结节性皮肤病病毒感染MDBK细胞后转录组差异表达分析

2021-02-27居马别克夏拉巴依李春燕马力克艾则孜

畜牧兽医学报 2021年2期
关键词:差异信号分析

曹 政,居马别克·夏拉巴依,李春燕,马力克·艾则孜*

(1.重庆市畜牧科学院,重庆 402460;2.新疆维吾尔自治区动物卫生监督所,乌鲁木齐 830011;3.陆军军医大学第一附属医院全军临床病理学研究所,重庆 400000)

牛结节性皮肤病(lumpy skin disease,LSD)是由牛结节性皮肤病病毒(lumpy skin disease virus,LSDV)所导致的传染病,其临床表现为病牛发热、淋巴结肿大、局部形成结节或溃疡,奶牛和小牛易感[1];该病的发病率在2%~45%,致死率高达20%[2]。LSD可导致流产,公牛和母牛不育,体重下降以及牛奶产量急剧下降,皮张利用价值低,从而造成严重的经济损失[1]。世界动物卫生组织(OIE)将其列为必须通报的疫病[3]。

LSD最早暴发于非洲,自2012年以来,该病已在中东、巴尔干地区、高加索南部和俄罗斯联邦的部分地区迅速传播[4],2015年,从土耳其传播到希腊东北部。并于2016年春季再次暴发,这次疫情波及到东南欧的多个国家[5]。2019年8月,LSD首次传入我国新疆伊犁州,这种远距离的跨境传播方式无疑加大了防控难度。目前,疫苗接种是最有效的预防LSD的方法,但迄今并无有效的治疗方法和疫苗产品。因此,鉴于我国首次暴发疫情,掌握我国流行毒株的特性及其与宿主细胞的相互作用将有利于加快新型疫苗的研发。

本研究中作者从暴发地采集了牛皮肤病变组织,接种MDBK细胞进行了病毒分离,并采用透射电镜观察病变组织及病毒感染后的MDBK细胞,同时,对感染后24 h的MDBK细胞进行转录组学分析,筛选差异表达基因并将其按功能分类,分析它们参与的细胞信号通路。本研究将为阐明LSDV与宿主相互作用及其致病机制提供线索,从而为疫苗产品的研发提供理论依据。……

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