唐丽昕，王天骄，刘华淼，张然然，邢秀梅

(中国农业科学院特产研究所 特种经济动物分子生物重点实验室，长春 130112)

梅花鹿(Cervusnippon)和马鹿(Cervuselaphus)是哺乳纲、偶蹄目、鹿科、鹿属的两个物种，其种间分化时间很短，一般很难得到确切的演化关系[1]。早在20世纪80年代，王宗仁和杜若甫[2]就从细胞遗传学角度，通过染色体核型来解释梅花鹿和马鹿的起源演化关系，指出鹿科动物染色体的进化方式主要是罗伯逊断裂[3]，主张马鹿(2n=68)是从梅花鹿(2n=66)演化而来的。而Frank等[4]就线粒体全基因组的研究指出，天山马鹿、东北马鹿和梅花鹿亚种之间的分化时间小于0.01 MYA(millions of years ago，距今百万年)，推测它们可能不是两个物种，可能属于梅花鹿的变种。现有的细胞遗传学和线粒体全基因组方面的研究，并没有很好的解释梅花鹿和马鹿演化关系的问题。随着生物技术的飞速发展，越来越多的学者从全基因组角度出发来分析物种进化关系[5-7]，这为梅花鹿和欧洲马鹿的演化关系研究提供了新的思路。

比较基因组学(comparative genomics)是在基因组图谱和测序基础上对已知的基因和基因组结构进行比较，来了解基因的功能、表达机理和物种进化的学科，其涉及物种内及物种间的基因组同源性、组成和功能的评估，并且已用于揭示从基因组进化到疾病调控等多方面的相关过程[8]。比较基因组学分为种内基因组比较和种间基因组比较两大类。种内基因组比较通常用于进行与物种适应性等特性有关的功能基因及特异性位点的研究[9-13]；……