宋思源，温芳，黄雯洁，陈晓雪，阮帅，顾苏平，顾培杏，周佳钰，李烨，刘佳彤，舒鹏

1 南京中医药大学附属医院肿瘤内科，南京 210029；2 南京中医药大学；3 江苏省中医院肿瘤内科

GC 患者的5 年生存率仅为20%～30%［1］。因此，寻找影响GC 发生、发展的关键基因和生物标志物对于GC 的早期诊断、早治疗、预后均具有重要意义。基因启动子区域的DNA 甲基化与癌基因、抑癌基因的沉默有关，可能与许多肿瘤发生、发展有关［2］。尽管一些研究［3］已证实，某些基因在GC 组织中存在异常的DNA 高甲基化或低甲基化，但其相互作用网络的全面概况和途径仍不明确。GC 患者中差异表达基因（Differentially expressed gene，DEG）和差异表达甲基化基因（Differentially Methylated gene，DMG）。但以往这些研究均没有对获得的DMG 基因进行综合分析，对GC 发病的核心基因相关研究较少。因此，2021年1月起，我们运用生物信息学方法筛选GC 发病的核心基因，并分析其生物学功能。现将结果报告如下。

1 材料与方法

1.1 数据来源 在GEO数据库（https：//www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/）中搜索关键字“GC”来获取GC基因表达数据集GSE118916和甲基化数据集GSE25869。GSE118916（平台：GPL15207 Affymetrix人类基因表达阵列）包括30例样本，其中GC患者15例，正常成人15例。GSE25869（平台GPL8490 Illumina HumanMethylation27 BeadChip）中纳入72 例样本，其中GC 患者24 例、正常成人48 例。本研究经南京中医药大学附属医院伦理委员会批准同意。

1.2 GC患者癌组织及健康成人胃组织中表达上调的低甲基化基因（high-regulated hypomethylated genes，Hypo-HGs）、表达上调的低甲基化（致）癌基因、表达下调的高甲基化基因（low-regulated hypermethylated genes，Hyper-LGs）及表达下调的高甲基化抑癌基因筛选 使用R 软件limma 数据包处理GSE118916、GSE25869数据集，以FDR ＜0.05 和|logFC|＞1 作为筛选DEG 的纳入标准，FDR ＜0.05 和|logFC|＞0.1 作为筛选DMG 的纳入标准。从癌……