姜林宏, 张鹤达, 钟山亮, 唐金海

胃癌是世界上大多数地区的一个重要的公共卫生问题[1-3],给世界各地带来了巨大的健康负担,尤其在中国[4]。据统计,2018年全球约有1 033 701例胃癌新发患者和782 685例胃癌死亡患者,在所有癌症中,胃癌的发病率和死亡率分别排在第五位和第三位[5]。目前尽管手术和辅助治疗方法都有所改进,但胃癌患者的临床治疗效果仍然很差,研究显示胃癌患者的5年总生存率一般低于30%[4],因此有必要进一步探索胃癌的发生发展机制,提供更积极、有效的治疗新思路。

环状RNA是一类结构稳定、组织特异性高的内源性RNA,它们将两个碱性末端以共价键的形式结合形成一个闭合的圆环,使其具有相对稳定的结构[6]。研究发现环状RNA在多种肿瘤中异常表达,包括乳腺癌[7]、肺癌[8]、肝癌[9]、结直肠癌[10]及胰腺癌[11]等。最新研究显示环状RNA富含miRNA结合位点,起到miRNA海绵的作用,从而在转录或转录后水平上调控基因的表达[12-17],如circRNA_001569过表达通过调控miR-145/NR4A2轴增强胃癌细胞活力,减少胃癌细胞凋亡[18];circRNA_100269通过靶向结合miR-630抑制胃癌细胞的增殖[19]。因此从环状RNA角度进一步筛选胃癌相关的新型靶点,并深入探讨其可能的分子机制,可能为胃癌的临床诊疗提供新的治疗方案。本研究通过从GEO数据库中下载微阵列数据,探索环状RNA在胃癌中的作用,以期为胃癌的生物学研究提供新的标志物。

1 材料与方法

1.1 微阵列数据 从GEO数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo)下载原始基因表达谱GSE78092(海南医科大学附属医院)、GSE89143(宁波大学医学院附属医院)和GSE83521(南方医科大学南方医院)。……