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129株非结核分枝杆菌采用两种分子检测技术行菌种鉴定的结果分析

2019-09-13刘佳文吕红艳丁北川张治国

中国防痨杂志 2019年9期

刘佳文 吕红艳 丁北川 张治国

非结核分枝杆菌(NTM),也曾称为非典型分枝杆菌,是指除结核分枝杆菌复合群(Mycobacteriumtuberculosiscomplex, MTC)和麻风分枝杆菌以外的分枝杆菌。现有的文献提示我国分离最多的NTM菌种为胞内分枝杆菌,在北方可达40%~60%[1]。近年来,随认识的提高和检查手段的提高,出现一些不常见的NTM菌种。四川省自贡市在国内首次报道外来分枝杆菌和奥巴涅分枝杆菌[2]。为探讨NTM分子菌种鉴定方法临床检查的应用意义,本研究对129株 NTM 临床分离株的菌种鉴定结果进行分析。

资料和方法

一、一般资料

NTM临床分离株来源于2014年北京老年医院(23株)、北京结核病控制研究所中心实验室(69株)、北京市昌平区结核病防治所(37株),共计129株。

二、试剂及方法

采用芯片杂交法(中国江苏猎阵生物科技有限公司)和16S rRNA基因测序法鉴定分枝杆菌(北京六合华大基因科技有限公司),2种方法实验操作者之间采用双盲法。芯片杂交法严格按厂家说明书进行操作。16S rRNA基因测序法来自文献[3]。

(一)芯片杂交法鉴定分枝杆菌

1.主要仪器及试剂:分枝杆菌菌种鉴定试剂盒(膜芯片法)(江苏猎阵生物科技有限公司),ETC811基因扩增仪,多孔板恒温振荡仪(型号:MB100-4A)。

2.分枝杆菌分离株DNA的提取:(1)取相应数量的1.5 ml的提取管标记。(2)向每个提取管中加入200 μl的“解液A”。(3)用Tip头挑取少量培养的菌落,放到加了“解液A”的提取管中,盖上盖。(4)将提取管在超级恒温混匀仪中进行金属浴10 min(恒温混匀仪参数设置:振荡强度1600 r/min,温度95 ℃)。(5)金属浴后,12 800×g离心3 min,上清液即可作为扩增模板进行扩增。……

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