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组蛋白单甲基转移酶SET8在肿瘤中的调节作用

2019-01-08申雪芳综述许平波审校

中国癌症杂志 2019年8期
关键词:糖酵解泛素细胞周期

申雪芳,花 晴 综述,许平波 审校

复旦大学附属肿瘤医院麻醉科,复旦大学上海医学院肿瘤学系,上海 200032

细胞的生长增殖依赖于细胞周期的正常运行,从间期的DNA合成前期(G1期)、DNA合成期(S期)与DNA合成后期(G2期),到细胞分裂期(M期);每个环节对于细胞正常生长和功能的维持都很重要,任何环节出现错误,都会导致细胞生长和功能的异常,进而导致肿瘤的发生[1]。SET8亦称PR-set7、SETD8或KMT5A,是哺乳动物中唯一的组蛋白单甲基转移酶。SET8定位于细胞核的染色体上,调节细胞周期的运行,SET8和组蛋白单甲基化在G2期最为丰富,而G1期和S期会降到最低[2-4];它作用于组蛋白以及非组蛋白的甲基化,维持细胞周期运行、调节细胞增殖和侵袭以及细胞代谢等,对于维持细胞的功能至关重要。研究发现很多肿瘤中SET8都高表达,如乳腺癌[5-6]、小细胞肺癌[7]、前列腺癌[8]、甲状腺癌[9]、肝癌[10]、肾癌[11]和卵巢癌[12]等。肿瘤作为一种由基因和环境共同作用而导致的慢性代谢性疾病,与转录后修饰调节的失调密切相关,本文选取表观遗传学中的一个位点-SET8,阐述其在肿瘤发生、发展中的作用及其机制。

1 SET8的分子生物学特征

在GeneCards数据库中检索发现,SET8(KMT5A)是包含SET区[Su(var),Enhancer of zeste,Trithorax]的甲基转移酶之一,其编码基因定位于12q24.31,包含25 586个碱基对。研究发现SET8可分为保守的SET区、Cdk1/Cyclin B区、D Box区、PIP Box区以及非保守区域,相互调节、相互作用的因子分别结合在SET8的功能区域,与之相互作用,调节细胞周期[1]。PIP Box位于SET区上游,通常与复制因子PCNA相结合,作为共刺激因子,促进SET8与CRL4Cdt2的结合,进而促进SET8泛素化以及蛋白酶依赖的降解,这也就是我们观察到的在S期,SET8水平降低的原因[1,13]。Cdk1/Cyclin B区、D Box区位于PIP Box区的上游,由APC/C(促进分裂后期复合物-细胞周期体)泛素化E3复合物识别并降解蛋白,而其上游的S29位点可被Cdk1/Cyclin B复合物识别,在G1~G2早期磷酸化S29位点,磷酸化的修饰并不改变SET8的活性,而是将其从分裂的染色体上移除;并且能够抑制SET8的泛素化和降解[14]。

2 在肿瘤中的作用

2.1 SET8作用于组蛋白,增加肿瘤的增殖和侵袭能力

研究发现SET8可作用于组蛋白,调节细胞周期与增殖凋亡,进而促进肿瘤的发生、发展。如在乳腺癌中,TWIST招募SET8于其靶基因E-cadherin和N-cadherin的启动子,正向调节TWIST和N-cadherin,抑制E-cadherin的表达,进而促进上皮-间质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT),促进肿瘤的侵袭和转移[5-6]。在前列腺癌中,二氢睾酮刺激后,SET8聚集于性激素受体的靶基因前列腺特异性抗原(prostate-specific antigen,PSA)基因的启动子区域,使该区域的H4K20me1增加,增加PSA的基因转录,促进癌细胞的增殖[15]。在此之前研究也发现,LEF1/TCF4招募SET8于Wnt信号的靶基因AXIN2、c-MYC、NKD1和LEF1的启动子,促进基因的表达,同样在结肠癌中SET8也调节Wnt信号的激活[8]。miR-382直接作用于SET8的3’-UTR,负向调节SET8,在神经胶质瘤中,miR-382下调,使得SET8表达增加,增加了神经胶质瘤的转移侵袭能力[16]。与之相似的是miR-7也能够作用于SET8的3’-UTR,负性调节SET8,能够抑制EMT并降低乳腺癌的转移和侵袭能力[17],miR-502通过对SET8 mRNA的3’-UTR不同的结合力,负向调节SET8转录水平,进而影响肿瘤的增殖和转移能力[7,10-12]。

SET8不仅可以促进基因的表达,增加肿瘤的增殖与转移,同时还可以参与基因的抑制作用。如在SET8发现之时,研究者就注意到,在男性和女性的X染色体上H4K16Ac和H4K20me呈相反的关系,H4K20me抑制邻近的赖氨酸乙酰化,进而发挥基因沉默的作用[18];我们知道H4K20me1在G2/M期会达到高峰,Vaquero等[19]发现在这一时刻SirT2也会定位在染色体中,并使H4K16Ac去乙酰化,Serrano等[20]后续补充了该通路:SET8招募SirT2与染色体,SirT2使SET8的K90位点去磷酸化,增加SET8的稳定性和活性,促进SET8的定位,同时SirT2也可以使临近核小体的H4K16Ac去磷酸化,进一步增加了SET8的甲基化。也有研究发现SET8可以招募L3MBTL1到其作用的基因的启动子区,增强L3MBTL1对下游基因的抑制作用,但其生物学作用仍有待进一步研究[21]。

2.2 SET8作用于非组蛋白,促进肿瘤的增殖

随着研究的不断深入,我们发现SET8还可作用于非组蛋白,如SET8不仅可以修饰细胞核内组蛋白的甲基化,也可以与抑癌基因P53相互作用,SET8单甲基化P53蛋白第382位点的赖氨酸(p53K382me1),抑制P53的生物学作用,降低其促进凋亡和抑制细胞周期的作用等[22]。后续的研究发现,SET8与P53的相互作用由Numb介导,SET8甲基化Numb的磷酸酪氨酸结合位点,阻断Numb与P53的结合,导致P53泛素化降解,进而发挥抑制凋亡等生物学作用[23]。有研究[17]报道,该调节作用可能是由miR-7介导,miR-7通过抑制SET8甲基化,促进P53的转录活性。SET8也可以甲基化增殖细胞核抗原(proliferating cell nuclear antigen,PCNA)第248位点的赖氨酸,抑制PCNA的泛素化降解,增加PCNA的稳定性,促进肿瘤的增殖[24]。

2.3 SET8对能量代谢的调节

自20世纪初发现有氧糖酵解之后,肿瘤的代谢方式便被认为是肿瘤的一大特点;虽然有氧糖酵解合成ATP的效率低于氧化磷酸化,但是它能更快地合成ATP,并且糖酵解的中间产物可以为细胞的生物合成提供底物,有利于肿瘤的发生、发展[25]。代谢和表观遗传修饰之间具有紧密的联系,二者互相调节;在肝癌中SET8除了能够促进肿瘤的增殖和侵袭,还能够影响肿瘤细胞的代谢变化,SET8通过KLF4/SIRT4信号转导通路,促进糖酵解,抑制线粒体呼吸,影响肿瘤细胞的代谢功能[26]。SET8能够增加ATP的合成,降低氧消耗,增加糖酵解,其机制为SET8与HIF-1共定位于细胞核,调节HIF-1及其下游基因(如HK2、PKM2、LDHA)的转录活性,SET8还可降低HIF-1的羟化和乙酰化,进而增加其稳定性;当通过降低氧供增加HIF-1的表达后,SET8可作为HIF-1的下游基因,其表达也会随之上升[5],但具体机制仍有待进一步探究。

此外也有研究认为,在甲状腺乳头状瘤中SET8除了增加肿瘤侵袭、促进转移、促进肿瘤进展外,还调节脂质的代谢,促进固醇调节元件结合转录因子1(sterol regulatory element binding transcription factor 1,SREBF1)的表达,以及其下游与脂质代谢相关的基因,如硬脂酰辅酶A去饱和酶(stearoyl-CoA desaturase,SCD)、脂肪酸合成酶(fatty acid synthase,FAS)和乙酰辅酶A羧化酶(acetyl-CoA carboxylase,ACC);而Liao等[9]研究认为,肿瘤高表达SET8与其预后不良相关,与之相似的是在胃癌患者中,SET8的高表达与患者的5年生存率降低相关,这可能成为判断肿瘤预后的独立预测因子[27]。

2.4 SET8在基因稳定性中的作用

研究发现SET8在维持基因稳定性、基因复制和细胞周期的正常循环中发挥重要作用,SET8缺失会导致细胞复制应激和染色体损伤,导致单链DNA含量增加[28]。外界因素导致的DNA损伤后,SET8的表达和p53K382me1都会降低;但是有研究也发现DNA损伤后,SET8依赖的DNA修复基因GADD45的表达量反而会上升,而其具体的机制和生物学作用仍需进一步的研究[22]。缺乏SIRT2基因后,断裂的双链DNA在S期增加,这与H4K20me1、H4K20me2减少以及基因稳定性降低有关,同时缺乏SIRT2基因也会导致肿瘤的发病率增加[20]。Takawa等[24]也发现SET8能够增强PCNA和核酸内切酶FEN1之间的作用,PCNA甲基化的降低可导致冈崎片段异常、DNA复制减慢以及DNA损伤等一系列问题。

3 在其他系统中的作用

SET8除了在肿瘤的发生、发展以及代谢中发挥重要的作用,在其他系统如免疫系统和血管内皮细胞等也有着重要的作用。SET8能够重新编码宿主的免疫反应,从而增加结核分枝杆菌的存活,SET8与单核细胞的氧化应激和凋亡相关,通过miR-30e-3p-FoxO3a作用于Nqo1和Txnrd1的启动子,促进NAD(P)H醌氧化还原酶1(NQO1)和硫氧还蛋白还原酶(thioredoxin reductase 1,TRXR1)的表达,而NQO1还能与PGC1相互作用,促进M2型单核细胞的极化,发挥抗炎的作用;SET8还可与肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)相关凋亡诱导配基(tumor necrosis factor-related apoptosis-inducing ligand,TRAIL)相互作用,发挥抗炎抗凋亡的作用[29]。同时SET8还可以通过53BP1影响子宫内膜腺体中DNA的修复,进而调节腺体的发生、发展,影响小鼠的生育能力[30]。

4 总结

SET8作为核小体H4K20的单甲基转移酶,在维持DNA复制、基因稳定性、细胞周期循环和基因的表达等方面发挥重要的作用。SET8通过作用于相应基因的启动子区或者直接作用于转录后修饰(非组蛋白修饰),调节染色体的折叠和基因的表达,维持细胞的功能。SET8表达的异常对于肿瘤的发生、发展具有重要的意义,研究发现在很多肿瘤中SET8都高表达,而其高表达能够促进肿瘤的能量代谢,促进肿瘤的进展、侵袭和转移。同时SET8的高表达与肿瘤的不良预后和生存率降低相关,其相关的机制仍有待于进一步研究。SET8与肿瘤的相关性使得其可能为判断肿瘤预后提供线索,并为临床开发治疗肿瘤的靶向药提供相应的靶点。

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