经共表达网络初探介入治疗后心房颤动的作用机制
2018-12-21吴晓峰
吴晓峰
(青海省心脑血管病专科医院 心内科,青海 西宁 810000)
目前,冠状动脉(以下简称冠脉)疾病患者在介入治疗时常伴有心律失常等不良反应。其中,心房颤动(atrial fibrillation, AF)是最常见的持续性心律失常,普通人群患病率为1%~2%[1-2]。AF患者的卒中风险较正常人群增加5倍,AF引起的缺血性卒中可能致命[3-6]。本研究将冠脉介入治疗后发生/未发生AF患者各4例进行转录组测序,分析这些样本差异表达的枢纽基因与临床表型(如AF等)之间的关系。
1 资料与方法
1.1 一般资料
选取2016年5月—2017年5月青海省心脑血管病专科医院收治的AF患者14例作为AF组,选取同期医院收治的冠脉介入治疗后未发生AF患者14例作为非AF组。两组各4例患者的左心房组织用于转录组测序,各10例患者的左心房组织用于基因表达的验证实验。在转录测序患者中,房颤组男性3例,女性1例;平均年龄(62.5±3.7)岁;高血压3例;非房颤组男性2例,女性2例;平均年龄(59.2±3.9)岁;高血压1例。AF组与非AF组患者的一般资料比较,差异无统计学意义(P>0.05),具有可比性。本研究经医院伦理委员会的审批同意,患者均在知情同意书上签字。
1.2 方法
1.2.1 高通量测序 深圳华大基因生物信息科技有限公司通过HiSeq 2000测序仪(美国Illumina公司)完成了本研究的转录组测序(RNA sequencing, RNASeq)工作。
1.2.2 测序数据的前处理 利用TopHat v2.01软件,比较参考基因和测序数据,通常状况下序列的比对率要求>90%[7]。以每百万读段的碱基片段(fragments per kilo bases per million reads, FPKM)评估基因表达的水平[8]。
1.2.3 差异基因表达分析 首先将冠脉介入治疗后两组患者左心房组织的基因表达水平……
