miRNAs在活动性肺结核患者和健康人血浆中的差异表达
2018-11-14滕新栋陈晓光顾长美
滕新栋,陈晓光,姜 华,顾长美,朱 可
(1.山东国际旅行卫生保健中心, 山东 青岛 266000; 2.威海出入境检验检疫局, 山东 威海 264200)
microRNAs(miRNAs)是一类微小、非编码和高度保守的单链RNA,可通过靶向信使RNA(mRNA)特异地调节基因表达。它具有多种生物学功能,在肿瘤、糖尿病和感染性疾病等多种疾病中发挥着重要调节作用。研究表明,血清或血浆中的循环miRNAs可作为筛选结核病(tuberculosis,TB)的重要靶标。
肺TB是由结核分枝杆菌引起的慢性传染性疾病,严重威胁着人类健康。据世界卫生组织(WHO)报道,2015年有1 040万新发TB病例,全球人口1/3感染M.tb(M.tuberculosis)[1]。鉴于TB的严重程度和TB诊断方法的发展情况,早期诊断对控制肺TB至关重要,但是目前没有有效的诊断肺TB的靶标。因而,需要发展全新、快速、敏感和有效的标志物来诊断肺TB。
本研究旨在利用高通量测序和实时荧光定量PCR(RT-qPCR)探讨肺TB患者和健康人血浆中miRNAs的差异表达情况,发现有诊断价值的miRNAs种类,为后续TB诊断试验和机制研究奠定基础。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 研究对象:选取青岛市黄岛区结核病防治所的肺TB患者5例,选取标准为痰涂片阳性或痰培养阳性。选取山东国际旅行卫生保健中心的健康人5名,选择标准为T-SPOT.TB阴性,无TB及其他疾病史,未接触过TB患者。所有研究对象均阅读并签署知情同意书,该研究经青岛大学附属医院伦理委员会批准。
1.1.2 试剂:Trizol®Reagent、6% Novex TBE PAGE gel(1.0 mm,10 well)和TBS380 Picogreen(Invitrogen公司);miRNA第一链cDNA合成(加尾法)试剂盒和2×SG Fast qPCR Master Mix[生工生物工程(上海)股份有限公司)];TruseqTMSmall RNA sample prep Kit、HiSeq 4000 PE Cluster Kit、HiSeq 4000 SBS Kit(300 cycles)和MiSeq Reagent Kits v3(600 cycles)(Illumina公司);Certified Low Range Ultra Agarose(Bio-Rad公司)。
1.2 方法
1.2.1 标本收集:用EDTA抗凝的旋盖采血管收集肺TB患者和健康人……
