吴明林 李海洋 江 河 何吉祥 侯冠军 蒋阳阳



草鱼呼肠孤病毒AH528株全基因组特征及进化分析*

吴明林 李海洋 江 河 何吉祥①侯冠军 蒋阳阳

(安徽省农业科学院水产研究所 合肥 230031)

草鱼出血病是由草鱼呼肠孤病毒(Grass carp reovirus, GCRV)引起的严重危害1~2龄草鱼的一种传染性疾病。本研究从安徽合肥地区患典型草鱼出血病的病鱼组织中分离到1株新的GCRV致病株，暂命名为GCRV-AH528。鱼体人工感染实验结果显示，实验鱼出现典型的出血病症状：体背发黑，鳍基部、腹部、口腔、鳃丝、肠道充血发红。全基因组特征分析显示，GCRV-AH528由11个双链RNA节段组成，节段大小在1027~3925 bp之间，AT平均含量为50.2%，GC平均含量为49.8%。与其他GCRVⅡ型毒株相比，L1节段在701~702位置缺少3个核苷酸(TAT)，少编码1个酪氨基；M4节段出现突变，含2个开放阅读框，编码2个非结构蛋白NS9和NS69。所有节段两端均含有6 bp保守的末端核苷酸序列5¢-GUAAU/CUžžžUU/GCAUC-3¢；另除L1、M6节段外，其余9个节段均在编码区两侧发现5~9 bp的颠倒互补序列。GCRV-AH528与其他呼肠孤病毒核苷酸平均相似度在37.1%~98.1%之间；编码蛋白平均相似度在24.3%~98.3%之间。基于VP1蛋白的聚类分析结果显示，该病毒属于水生呼肠孤病毒属，在氨基酸水平上与典型株GCRV-873株的进化关系较远。本研究结果表明，该毒株为一株新的草鱼呼肠孤病毒Ⅱ型致病株。

草鱼出血病；草鱼呼肠孤病毒；VP1蛋白；水生呼肠孤病毒

草鱼()是中国淡水养殖的主要品种之一，除西藏、青海零星养殖外，在我国各地均有较大规模的养殖。中国渔业统计年鉴显示，2015年我国淡水鱼类养殖产量为3062.27万t，其中，草鱼的养殖产量为567.62万t，为我国所有养殖鱼类之首(农业部渔业渔政管理局, 2016)。……