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Ion torrent半导体测序技术在胎儿非整倍体疾病筛查中的应用

2018-11-07杨媛媛何文竹尹宗智

安徽医科大学学报 2018年11期
关键词:检测

杨媛媛,何文竹,袁 静,李 莉,尹宗智

无创DNA产前检测(non-invasive prenatal testing,NIPT)是利用二代测序技术(next generation sequencing, NGS)对母体血浆中游离胎儿DNA进行高通量测序,可准确、安全地对胎儿染色体非整倍异常疾病进行筛查[1-4]。Ion torrent半导体测序技术是在二代454测序技术基础上,在信号检测环节摒弃了焦磷酸偶联反应检测,而采用先进的半导体H离子检测技术,使其在保持了454的诸多优点(如波长长、应用范围广泛等)基础上,具有高通量、检测简单迅速、成本低的优势[5-6],该项技术的临床应用价值仍需验证和评估。该研究利用Ion Torrent半导体测序平台检测孕妇外周血浆中的游离DNA,行胎儿染色体非整倍体的无创产前检测,以研究无创产前基因检测技术的敏感性、特异性, 从而探讨无创DNA检测技术在产前诊断中的临床实际应用价值。

1 材料与方法

1.1病例资料选择2015年1月~2017年3月在安徽医科大学第一附属医院接受遗传咨询并知情同意下行无创产前检测患者。

入组标准:① 血清学筛查、影像学检查显示为常见染色体非整倍体临界风险(即 1/1 000≤唐氏综合征风险值<1/270,1/1 000≤18-三体综合征风险值<1/350)的孕妇;② 有介入性产前诊断禁忌证者(先兆流产、发热、有出血倾向、感染未愈等);③ 就诊时,患者为孕 20+6周以上,错过血清学筛查最佳时间,或错过常规产前诊断时机;④ 高龄孕妇(年龄35岁)或常规血清学检查高风险孕妇,在接受遗传咨询下要求无创产前检测 。

排除标准:① 多胞胎孕妇;② 既往妊娠胎儿有染色体异常;③ 夫妻双方有染色体疾病携带、遗传基因病家族史;④ 孕妇接受过异体输血、移植手术或干细胞治疗,或肿瘤患者等。

1.2无创DNA检测方法抽取孕妇外周血5 ml置于 EDTA 抗凝管内,4 ℃保存,在4 h 内分离血浆提取胎儿游离DNA,利用Ion Torrent 半导体测序平台测序,通过生物信息分析得出胎儿患21-、18-、13-三体综合征的风险率,检测结果介于-3.0~+3.0为低风险,对其胎儿出生后情况进行电话随访;……

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