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基因组大数据在生物安全中的应用

2018-03-31朱联辉李京京曹诚

生物技术通讯 2018年1期
关键词:研究

朱联辉,李京京,曹诚

军事医学研究院 生物工程研究所,北京 100071

随着基因组测序技术的迅猛发展,我们目前所面临的最紧迫问题已经不再是测序技术本身,而是面对基于高通量测序技术产出的海量数据,如何进行储存、管理和分析挖掘。按照现在的测序能力,一个星期产生的数据量即相当于几年前一个大型基因组测序中心一年的产出量。如何面对这种兆兆级字节(terabyte)的数据量,已经成为各个从事基因组研究工作的实验室必须解决的问题。面对海量的基因组大数据,如何应用其来创新探索未来的生命科学和医学科学,乃至其他科学和产业领域,以及如何在庞大的数据资源中快速获取信息以提升人类生物安全能力,是亟待探讨的现实问题[1]。

近几年来,随着科研工作者和相关产业人士的共同努力,使得基因组大数据的应用对生命科学、医学和相关产业的推动效应已初见端倪,并成功地助力病原体进化溯源分析、微生物领域科学突破、精准医学新检测方法和治疗药物开发等方面,为提高生物安全防护能力研究提供了重要的基础。

1 助力病原体进化溯源分析研究

1.1 H7N9分子进化与溯源

2013年3月底,一种新型H7N9流感在中国暴发,随后疫情迅速扩散到华东与华北地区的多个省市。因为其较高的感染性,引发了社会各界的高度关注。Gao等[2]依据最早获得的流感病毒序列构建系统发育树,发现其HA节段与我国2011年在浙江分离的H7N3鸭流感病毒HA节段在进化上具有共同起源;……

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