快速老化痴呆小鼠海马组织差异表达基因模式分析及治疗药物预测
2018-02-13刘涛张雪竹贾玉洁韩景献聂坤
刘涛,张雪竹,贾玉洁,韩景献,聂坤
(天津中医药大学第一附属医院,天津300193)
阿尔茨海默病是一种常见的神经退行性疾病,主要临床表现为进行性记忆障碍、失语、认知能力下降,其发病机制目前尚不明确[1]。老化是阿尔茨海默病的危险因素,但并不是所有人在老化过程中均出现阿尔茨海默病。因此,揭示阿尔茨海默病独有的老化模式,有助于阐明老化在阿尔茨海默病发生、发展过程中的作用机制。基于大数据的系统生物学分析方法为定性分析阿尔茨海默病的老化模式提供了可能性。美国国立卫生研究院NIH资助建立的网络集成式细胞内特征的公共数据(LINCS)项目(http://www.lincsproject.org/),开发了Connectivity Map(Cmap)数据库,收集使用化合物处理和相关基因干扰剂处理的人类细胞基因表达信息。Cmap数据库包含大量细胞水平反应模式数据,同时开发了多种系统生物学分析工具,可从样品的基因组学数据进行模式化定性分析,揭示某种干预手段或药物处理对细胞基因表达模式的影响及可能机制[3]。SAMP8小鼠是一种典型的快速老化痴呆小鼠,在成年期即可出现典型伴随痴呆的快速老化特征,是常用的阿尔茨海默病动物模型[4]。2016年1月~2017年12月,我们分析了SAMP8小鼠及SAMR1小鼠海马组织差异表达基因,利用LINCS数据库模式化分析快速老化痴呆小鼠海马组织差异表达基因特征,并预测老年痴呆的治疗药物。现报告如下。
1 材料与方法
1.1 材料 2月龄(幼年)、8月龄(老年)SAMP8小鼠各20只(雌雄各半),2月龄(幼年)、8月龄(老年)SAMR1小鼠各20只(雌雄各半),均由天津中医学院第一附属医院实验动物中心提供[动物许可证号SXCK(津)2015-0003],饲养条件完全相同,自由摄食饮水。……
