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4株水果采后链格孢属真菌的rDNA ITS区序列与碳源代谢指纹图谱差异性分析

2018-02-01任向峰王友升

食品科学技术学报 2018年1期

任向峰, 姚 婷, 张 萌, 张 燕, 王友升

(北京工商大学 北京食品营养与人类健康高精尖创新中心, 北京 100048)

*王友升,男,教授,博士,主要从事果蔬绿色保鲜及其高值化方面的研究,通信作者。

链格孢属(AlternariaNees) 真菌作为果实采后常见的潜伏侵染病原菌,是半知菌暗色丝孢菌中重要的一类[1],目前,全世界已经报道的链格孢属真菌约500种且仍不断发现新种[2-3],仅在果蔬常见的就有互隔交链孢(A.alternata)[4]、细极链格孢菌(A.tenuissima)[5]、胡萝卜链格孢(A.dauci)[6]和葱链格孢(A.porri)[7]等,但对于属内种间的亲缘关系尤其碳源代谢指纹图谱的差异性,需要进一步理清。

利用不同物种间核糖体DNA的ITS区可能存在的碱基差异性,通过PCR扩增ITS区并进行同源性分析,可以对真菌进行鉴定[8-9]。Biolog 微生物自动分析系统可通过检测特定菌株对95种碳源的利用情况,获得该菌种的碳源代谢指纹图谱[10-12]。拮抗酵母菌的ITS区序列与碳源代谢指纹图谱可有效获取其生防能力的差异性基础[13]。将ITS区序列与碳源代谢指纹图谱表型特征相结合,对桃、李果实采后褐腐病菌的亲缘关系进行区分,且两种方法具有可比性[14]。前期的研究也表明,通过李果实采后病原菌串珠状赤霉(Gibberellamoniliformis)、链格孢菌(Alternariaalternata)、 草酸青霉(Penicilliumoxalicum)和塔宾曲霉(Aspergillustubingensis)之间的ITS区序列与碳源代谢指纹图谱表型差异可推测出病原菌寄主特异性的物质基础[15]。

本研究分别从采后贮藏期发病的冬枣、樱桃、杏和蓝莓果实中分离得到4株病原真菌,通过形态学特征和rDNA ITS区序列分析进行鉴定,并对分子系统进化树和碳源指纹聚类分析结果进行比较,以期为不同果实采后病原菌的营养生理研究、病害防治及真菌种间关系研究提供参考。……

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