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催乳素处理的乳腺癌T-47D细胞lncRNA和mRNA表达谱差异分析

2017-10-24朱林静姚俊魏钦俊鲁雅洁曹新

生物技术通讯 2017年5期
关键词:乳腺癌差异信号

朱林静,姚俊,魏钦俊,鲁雅洁,曹新

南京医科大学 基础医学院生物技术系,江苏 南京 211166

研究报告

催乳素处理的乳腺癌T-47D细胞lncRNA和mRNA表达谱差异分析

朱林静,姚俊,魏钦俊,鲁雅洁,曹新

南京医科大学 基础医学院生物技术系,江苏 南京 211166

目的:观察催乳素处理引起乳腺癌T-47D细胞中长链非编码RNA(lncRNA)和mRNA表达谱的变化。方法:利用转录组测序技术检测催乳素处理前后乳腺癌T-47D细胞中lncRNA和mRNA的表达谱;通过数据库KEGG、GO富集对有差异表达且具有统计学意义的mRNA进行通路分析,得到mRNA参与的生物学途径;运用荧光定量PCR(qRT-PCR)技术对部分差异表达的 lncRNA(lnc-AK4-2、XLOC_075541、XLOC_093371、XLOC_081110、XLOC_047068、XLOC_006637、XLOC_064063、XLOC_086865、XLOC_099517、XLOC_106798、lnc-ZNF639-1)进行验证,并利用生物信息学方法预测其靶基因,通过数据库KEGG、GO富集对差异lncRNA的靶基因进行通路分析。结果:分析得到3564个差异lncRNA和477个差异mRNA(差异倍数>2,P<0.05),差异表达的mRNA主要富集在134条不同的信号通路,其中包括催乳素/催乳素受体信号通路相关的MAPK信号通路、p53信号通路和JAK-STAT信号通路;选取的11条lncRNA的变化趋势(XLOC_093371、XLOC_006637、XLOC_064063、XLOC_086865、lnc-ZNF639-1表达上调,lnc-AK4-2、XLOC_075541、XLOC_081110、XLOC_047068、XLOC_099517、XLOC_106798表达下调)经qRT-PCR技术得到验证;lncRNA靶基因富集的信号通路同样包括MAPK信号通路。结论:催乳素处理前后T-47D细胞中lncRNA的表达存在明显差异,为进一步研究与乳腺癌发病机制相关的关键lncRNA分子提供了基础,并为寻找乳腺癌潜在的诊疗方法提供理论支持。

长链非编码RNA;表达谱;乳腺癌;催乳素;T-47D细胞

乳腺癌是当今困扰女性健康的最普遍的癌症之一,且其发病率呈逐年上升的趋势,由于乳腺癌起病隐匿,部分乳腺癌患者检出或确诊时已属中晚期,治疗效果不甚理想,因此早期诊断、早期治疗是提高生存率的关键[1]。……

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