APP下载

SRSF2基因的生物信息学分析与蛋白质预测

2017-10-24李明阳马春霞吴翰欣吴小海杨渊俞建昆

生物技术通讯 2017年5期
关键词:小鼠人类分析

李明阳,马春霞,吴翰欣,吴小海,,杨渊,,俞建昆

1.中国医学科学院&北京协和医学院 医学生物学研究所 中心实验室,云南 昆明 650118;2.昆明医科大学 附属第二医院,云南 昆明 650118

SRSF2基因的生物信息学分析与蛋白质预测

李明阳1,马春霞1,吴翰欣2,吴小海1,2,杨渊1,2,俞建昆1

1.中国医学科学院&北京协和医学院 医学生物学研究所 中心实验室,云南 昆明 650118;2.昆明医科大学 附属第二医院,云南 昆明 650118

目的:分析富含丝氨酸和精氨酸的剪接因子2(SRSF2)基因序列和表达产物的特征。方法:运用生物信息学相关软件分析和预测人类和小鼠SRSF2基因的同源区段、开放读框、启动子区域、转录因子结合位点、CpG岛分布情况,分析预测小鼠SRSF2基因蛋白产物的功能结构域以及与其他蛋白的相互作用。结果:人类和小鼠SRSF2基因共有3个同源区段、19个开放读框、4个相同的转录因子结合位点,2个基因的CpG岛各项参数基本一致;小鼠SRSF2蛋白会与至少10种其他蛋白因子发生相互作用。结论:SRSF2基因及其蛋白产物的生物信息学分析,为相关研究提供了重要的信息基础。

富含丝氨酸和精氨酸的剪接因子2(SRSF2);生物信息学;蛋白质相互作用

真核生物的结构基因由多个编码和非编码序列互相间隔但又连续镶嵌形成,绝大部分基因转录出前体mRNA(pre-mRNA)后需要通过剪除非编码序列后再连接成为成熟的mRNA,方可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质,这些基因我们称之为断裂基因(split gene)。

可变剪接是真核生物中普遍存在的一种分子加工过程,人类95%以上的基因都受到可变剪接的调控[1-2],可变剪接调控过程异常将会导致多种疾病,如Frasier综合征、脊髓性肌肉萎缩等[3]。……

登录APP查看全文

猜你喜欢

小鼠人类分析
爱捣蛋的风
人类能否一觉到未来?
隐蔽失效适航要求符合性验证分析
小鼠大脑中的“冬眠开关”
人类第一杀手
1100亿个人类的清明
电力系统不平衡分析
电力系统及其自动化发展趋势分析
人类正在消灭自然
加味四逆汤对Con A肝损伤小鼠细胞凋亡的保护作用