转录组分析棒状链霉菌F613-1高产克拉维酸的分子基础
2017-09-16覃荣活付加芳宗工理王志宇曹广祥
覃荣活付加芳宗工理王志宇曹广祥
(1. 济南大学山东省医学科学院医学与生命科学学院,济南 250022;2. 山东省医药生物技术研究中心,济南 250062)
转录组分析棒状链霉菌F613-1高产克拉维酸的分子基础
覃荣活1,2付加芳2宗工理2王志宇2曹广祥1,2
(1. 济南大学山东省医学科学院医学与生命科学学院,济南 250022;2. 山东省医药生物技术研究中心,济南 250062)
旨在探究S. clavuligerus工业菌株高产克拉维酸(CA)的分子基础。采用转录组高通量测序,对比标准菌株和高产CA的工业菌株F613-1之间的基因转录水平差异,结合菌株表型差异进行综合分析。结果表型比较显示,F613-1在固体培养基中生长速度、气生菌丝形态、孢子形成等方面与标准菌株存在差异。液体摇瓶培养中,菌体生长速度无明显变化,但F613-1的糖消耗量显著降低,同时CA产量比ATCC27064提高约11.7倍。转录组分析显示,F613-1中CA基因簇及其途径特异性调控基因的表达量显著升高,其副产物全霉素基因簇的表达量显著下降;CA合成原料精氨酸和3-磷酸甘油醛代谢相关基因的转录水平发生显著变化,精氨酸合成代谢基因上调,而3-磷酸甘油醛分解代谢基因下调;ABC转运系统中80多个基因的转录水平也发生明显变化,其中42个显著上调,38个显著下调。工业生产菌株高产克拉维酸的主要原因是CA基因簇及其调控基因表达量的升高、相关副产物基因簇的沉默及CA合成原料精氨酸和3-磷酸甘油醛的积累。
棒状链霉菌;工业菌株;转录组;克拉维酸
克拉维酸(Clavulanic acid,CA)是一种高效的β-内酰胺酶抑制剂,广泛应用于临床治疗β-内酰胺类抗生素耐药菌的感染[1]。……
