功能性消化不良患者唾液菌群的研究*
2017-06-05刘婉薇李良芳岑荣英聂胜利卢艳娴李锐锋李子俊
陈 瑜,刘婉薇,李良芳,岑荣英,聂胜利,卢艳娴,,李锐锋,,李子俊,△
(1.南方医科大学,广州 510515;2.广东省人民医院/广东省医学科学院,广州 510080)
·生物信息学·
功能性消化不良患者唾液菌群的研究*
陈 瑜1,刘婉薇2,李良芳2,岑荣英2,聂胜利2,卢艳娴1,2,李锐锋1,2,李子俊1,2△
(1.南方医科大学,广州 510515;2.广东省人民医院/广东省医学科学院,广州 510080)
目的 分析功能性消化不良患者与健康对照者唾液菌群的差异。方法 收集功能性消化不良患者及健康对照者的唾液标本,提取总基因组DNA,采用高通量测序技术对样本中细菌的16S rRNA-V4区进行DNA测序后进行生物信息学分析。结果 功能性消化不良组唾液中的菌群以变形菌门为主,健康对照组以拟杆菌门为主。功能性消化不良唾液菌群的Chao1、ACE、Shannon指数分别为1 295、1 351、4.93,健康对照组为1 001、1 019、5.28。 PCoA可基本将两组间的唾液菌群区分开。LEfSe分析发现两组间有差异菌群共有16个,包括普式菌属、奈瑟菌属及变形菌门等。结论 功能性消化不良患者唾液有其特征性的菌群组成,以变形菌门为主,但两组间的丰富度及多样性无差别,奈瑟菌属是两组间差异显著的细菌之一。
功能性消化不良;唾液;细菌;奈瑟菌属
胃及食管长期以来均被认为“无菌”或仅有“过路菌”,而近年来通过高通量测序等技术发现胃及食管都有着其独特的细菌组成。Bik等[1]研究发现,胃黏膜中细菌主要由厚壁菌门及变形菌门组成,而细菌与上消化道疾病的关系也越来越受到重视。研究[2-3]发现,反流性食管炎、Barrett食管与正常的食管黏膜细菌组成不同,不同的细菌群落可能与食管疾病有关[4]。……
