基于下一代测序平台的结直肠癌KRAS基因检测
2016-12-02李丽娟罗婉珊张家彬王庆吴英松
分子诊断与治疗杂志 2016年6期
李丽娟 罗婉珊 张家彬 王庆 吴英松
·论著·
基于下一代测序平台的结直肠癌KRAS基因检测
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目的基于下一代测序技术,检测和分析结直肠癌KRAS基因的突变情况,以及评估其应用于临床分子诊断中的可行性。方法应用Ion Proton半导体测序仪,检测108例结直肠癌患者的石蜡包埋组织样本的KRAS基因突变情况,并与作为金标准的一代测序检测结果进行对比。结果下一代测序检测结果与一代测序检测结果基本一致,符合率为94%,灵敏度高达100%。结论通过对108例临床样本的检测分析后,该下一代测序检测方法可用于检测结直肠癌KRAS基因突变情况。
下一代测序;结直肠癌;KRAS
RAS家族之一的KRAS基因位于12p12.1,编码分子量为21 kD、具有GTP酶活性的p21蛋白[1]。KRAS为EGFR信号传导通路RAS⁃RAF⁃MAPK中的重要因子。机体正常的KRAS基因,通过控制相关路径抑制癌细胞的生长。突变型KRAS基因,在无需活化EGFR的条件下,激活下游信号传导通路,导致细胞的生长、增殖和凋亡发生异常。细胞传导信号的紊乱以及增殖的失控会导致细胞癌变。KRAS基因主要在第12、13位密码子上发生突变,以点突变为主,在第61位密码子上可见少数突变[2]。
KRAS是人体肿瘤中常见的致癌基因,其中20%~50%的结直肠癌患者伴有KRAS基因突变。其突变出现在结直肠癌的早期阶段,不受治疗的影响而维持稳定状态[3]。KRAS是第一个对临床治疗结直肠癌的决策产生影响的生物标记物,是帮助了解相关基因和癌症的发展预后、疗效的关键指标。当KRAS基因为突变型时,则不建议采用……p>
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