王辉芳 梁志坤 叶倩平 杨旭

·论著·

运用半导体测序法检测4种遗传病常见突变

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目的运用基于半导体芯片技术的下一代测序方法对地中海贫血、遗传性耳聋、苯丙酮尿症和肝豆状核变性病相关的38个常见致病突变位点进行基因测序，探讨半导体测序技术在遗传病检测方面的应用价值。方法采用AmpliSeq方法通过多重PCR捕获目的片段，然后构建文库，用Ion Torrent ProtonTM测序仪进行测序反应，进而通过Sanger一代测序法进行结果比较验证。结果33个样本中共检测出15例样本存在功能性遗传变异，其中HBB：52A＞T 5例、HBB：84_85insC 3例、HBB：45_ 46insG 2例、HBB：2T＞G 1例、GJB3：538C＞T 1例、ATP7B：2333G＞T 1例、GJB2：235delC 1例、SLC26A4：IVS7⁃2A＞G 1例，Sanger一代测序结果与下一代测序结果完全一致。结论半导体测序能准确检测该4种遗传病常见突变，对遗传病发病机制的研究及筛查具有一定的应用价值。

半导体测序；下一代测序；Ion Torrent ProtonTM；遗传病；基因突变

地中海贫血、遗传性耳聋、苯丙酮尿症及肝豆状核变性病为国内4种常见的高发遗传病，严重影响我国出生人口素质。地中海贫血（thalas⁃semia）（简称“地贫”）是一组全球最常见、对人类健康影响最大的单基因遗传病［1］。α⁃地贫发病相关基因为HBA2，β⁃地贫发病相关基因为HBB［2⁃4］。遗传性耳聋是影响人类健康和致残的常见病，据统计，新生儿中耳聋的发病率为1‰［5］，其中大约一半的耳聋与遗传因素相关［6⁃7］，相关基因主要有GJB2、GJB3和SLC26A4等。苯丙酮尿症（phenylketonuria，PKU）是由于肝脏苯丙氨酸羟化酶（phenylalanine hydroxylase，PAH）缺乏所致的一种严重的遗传性氨基酸代谢障碍性疾病，呈常染色体隐性遗传［8］，该病可分为经典型PKU与非经典型PKU 2种类型［9⁃10］。……