岳晓凤，阙亚伟，王政逸

（浙江大学农业与生物技术学院水稻生物学国家重点实验室，杭州 310058）

基于RNA-Seq的稻瘟病菌Δznf1突变体的表达谱分析

岳晓凤，阙亚伟，王政逸

（浙江大学农业与生物技术学院水稻生物学国家重点实验室，杭州 310058）

【目的】稻瘟病菌（Magnaporthe oryzae）引起的水稻稻瘟病是威胁全球水稻生产的重要病害之一，而该菌附着胞介导的侵染又是病害循环的重要环节。在前期的研究中发现一个编码C2H2锌指结构的转录因子基因ZNF1，参与稻瘟病菌附着胞形成、穿透和致病过程,论文旨在从转录水平上了解受Znf1调控的基因及其调控机理，为深入研究稻瘟病菌致病分子机理提供基础数据。【方法】利用RNA-Seq技术对稻瘟病菌野生型菌株Guy11和突变体Δznf1的营养菌丝体进行表达谱测序，采用FPKM法计算基因表达量，以FDR≤0.001且log2ratio (Δznf1/Guy11)≥1为筛选标准，获得Δznf1中差异表达基因（differentially expressed genes, DEGs）；通过与Gene Ontology（GO）数据库和KEGG Pathway数据库比对，获得差异基因可能的生物学功能和参与的分子调控途径。为了更详细地研究受Znf1调控的基因，在同样的条件下，利用RNA-Seq技术对稻瘟病菌丝裂原活化蛋白激酶（mitogen-activated protein kinase，MAPK）编码基因PMK1的缺失突变体进行表达谱分析，通过对Δznf1和Δpmk1中的差异表达基因进行比较，筛选受Znf1和Pmk1共同调控的基因，并与前人的研究数据比较，分析获得在稻瘟病菌附着胞发育阶段上调表达但在Δznf1和Δpmk1中同时下调表达的基因。【结果】与野生型Guy11相比，Δznf1中共有709个差异表达基因，其中上调表达的有299个，下调表达的有410个；GO功能富集分析显示差异表达基因归类到生物学过程、细胞组分和分子功能上的基因数目分别有118、299和308个；……