利用SSR分子标记研究国内外黍稷地方品种和野生资源的遗传多样性
2016-12-01乔治军刘敏轩王瑞云
连 帅,陆 平,乔治军,张 琦,张 茜,刘敏轩,王瑞云
(1山西农业大学农学院,山西太谷 030801;2中国农业科学院作物科学研究所,北京 100081;3山西农业科学院品种资源研究所,太原 030031)
利用SSR分子标记研究国内外黍稷地方品种和野生资源的遗传多样性
连 帅1,2,陆 平2,乔治军3,张 琦2,张 茜2,刘敏轩2,王瑞云1
(1山西农业大学农学院,山西太谷 030801;2中国农业科学院作物科学研究所,北京 100081;3山西农业科学院品种资源研究所,太原 030031)
【目的】从分子水平研究国内外黍稷种质资源的遗传多样性差异,为黍稷种质资源的研究、保护和利用提供依据。【方法】用不同地理来源且性状差异显著的6份黍稷种质资源对来自高通量测序技术开发的黍稷基因组SSR引物进行筛选,从而获得条带清晰,稳定性好的63对SSR黍稷基因组引物,利用这63对SSR多态性引物对来自国内外的192份黍稷地方品种和野生种质进行遗传多样性分析。统计各试材在同一引物中的条带情况,并以此来分析试材的遗传多样性与所在群体间的亲缘关系。【结果】63对SSR引物共检测出161个等位变异位点,平均每个SSR位点2.56个;平均Shannon-Weaver指数(I)为0.6275,平均基因多样度(Nei)为0.3874,平均PIC值为0.4855。10个不同地理来源群体间表现出显著的遗传多样性差异,各群体的有效等位变异变化范围较窄,最小的是南方群体,为1.2407±0.4315;最大的是内蒙古高原群体,为1.8846±0.4892。国内群体Shannon-Weaver指数为内蒙古高原>东北地区>黄土高原>西北地区>南方地区,而国外Shannon-Weaver指数排序依次为前苏联>欧洲>蒙古>印度>美国。从Nei’s基因杂合度分析,观察杂合度(Ho)最小的是印度群体,为0.2372±0.2962,最大的是内蒙古高原群体,为0.3966±0.3250。……
