何　浪　魏　娜　郭　政　王　丹

(电子科技大学生命科学与技术学院,成都610054)



良恶性乳腺肿瘤外周血基因差异表达研究①

何浪魏娜②郭政③王丹③

(电子科技大学生命科学与技术学院,成都610054)

目的：利用基因表达谱数据，探讨良恶性乳腺肿瘤患者外周血基因表达变化。方法：从GEO 数据库中获取良性和恶性乳腺肿瘤患者外周血单个核细胞(PBMCs)表达谱。GEO2R 在线工具筛选差异表达基因， DAVID 工具富集基因功能和通路。STRING数据库构建差异表达基因蛋白产物相互作用的网络，筛选核心基因。结果：良恶性乳腺肿瘤分别筛选到563和237个差异基因，乳腺癌差异基因涉及白细胞激活、血管生成等生物学过程以及白细胞跨内皮迁移信号通路。IL8、RHOB、ITGB1等为关键基因。结论：良恶性乳腺肿瘤患者外周血基因表达模式存在明显差异，为将外周血作为替代材料应用于乳腺肿瘤的诊断及监测研究开辟了新思路。

乳腺肿瘤；外周血单个核细胞；差异表达基因；通路富集分析

乳腺癌是常见的女性恶性肿瘤，已排在肺癌之后，成为女性第二位常见恶性肿瘤[1]。外周血被认为是无创性分子诊断的理想材料。外周血单个核细胞(Peripheral blood mononuclear cells，PBMCs)由众多免疫细胞组成，是机体免疫防御体系的基本要素，监控机体生理状态，其基因表达模式的改变是机体对病理刺激做出的及时反应[2]，相比于手术中一次取样的肿瘤组织，外周血更具有动态性。基因芯片的广泛应用，为疾病诊断、疾病发展机制研究提供了大量高通量的基因表达数据，对这些数据的再分析可以为新的研究提供有价值的线索[3,4]。……