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饵料对鳡肠道微生物多样性的影响

2016-08-10蕾向建国曾丹李宁求

水生生物学报 2016年4期

钟 蕾向建国曾 丹李宁求

(1. 湖南农业大学动物科学技术学院, 长沙 410128; 2. 水产动物免疫重点实验室, 广州 510380)

饵料对鳡肠道微生物多样性的影响

钟 蕾1向建国1曾 丹1李宁求2

(1. 湖南农业大学动物科学技术学院, 长沙 410128; 2. 水产动物免疫重点实验室, 广州 510380)

通过PCR-DGGE指纹分析并结合克隆、测序对饲喂人工配合饲料和冰鲜鱼两种不同饵料的鳡肠道微生物群落结构及多样性差异进行了比较研究。摄食配合饲料和冰鲜鱼的鳡肠道样品中分别检测到21条和17条清晰的DGGE指纹条带; 进一步的克隆、测序及BLAST比对分析表明, 21条测序谱带与GenBank数据库中已知微生物的同源性为98%—100%。配合饲料饲养鳡肠道微生物特有条带代表种群主要为魏斯氏菌(Weissella koreensis)等, 冰鲜鱼饲养鳡特有条带代表种为威斯康星米勒菌(Moellerella wisconsensis)等。从PCR-DGGE指纹相似性来看, 不同饵料饲养鳡的肠道细菌组成差异较为明显, 相似性仅为11.9%—42.6%。鳡肠道菌群的DGGE 指纹图谱中条带的H′指数(Shannon-Weiner 指数)最高为配合饲料饲养鳡第Ⅴ组样本, 达到2.84, 最低的为冰鲜鱼饲喂下的鳡第Ⅵ组样本, 为2.46。研究结果表明, 投喂人工配合饲料和冰鲜鱼会对鳡肠道菌落产生影响, 可为鳡饲料的开发提供一定的基础依据。此外, 两类鳡的肠道群落PCR-DGGE指纹图谱有助于这两种鳡产品的跟踪和肠道益生菌研究。

鳡; 肠道微生物; 变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE); 16S rDNA

鳡(Elopichthys bambusa)是我国少有的大型名贵鱼类之一, 自然条件下主要以麦穗鱼、鲫、鲌类等幼鱼为食, 人工放养主要投喂鲢、鳙等家鱼或冰鲜鱼, 近年来改用驯化饲料饲喂[1]。……

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